26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1928 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1928  polysaccharide biosynthesis protein CelD  100 
 
 		 364 aa  738    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411311  normal  0.123399 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7654  cellulose biosynthesis protein CelD  54.12 
 
 		 376 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3587  hypothetical protein  51.8 
 
 		 363 aa  364  1e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7661  polysaccharide biosynthesis protein CelD  49.58 
 
 		 363 aa  337  9.999999999999999e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3602  polysaccharide biosynthesis protein CelD  47.93 
 
 		 363 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317396  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1930  polysaccharide biosynthesis protein CelD  46.26 
 
 		 360 aa  301  1e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0135323  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0656  hypothetical protein  36.78 
 
 		 349 aa  173  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4871  hypothetical protein  32.94 
 
 		 360 aa  164  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2354  hypothetical protein  33.43 
 
 		 381 aa  160  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0440  hypothetical protein  30.55 
 
 		 372 aa  157  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.463768 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1351  hypothetical protein  31.96 
 
 		 376 aa  156  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1755  cellulose biosynthesis protein CelD  28.78 
 
 		 359 aa  144  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189987  normal  0.140777 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1683  cellulose biosynthetic (CelD)-like protein  28.65 
 
 		 359 aa  143  5e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.548843  normal  0.0452897 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0664  cellulose biosynthesis protein CelD  27.88 
 
 		 326 aa  53.1  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.250925 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2698  hypothetical protein  25.11 
 
 		 400 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.402222  normal  0.567569 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0249  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.2 
 
 		 421 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.801675 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8156  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  26.56 
 
 		 468 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3092  conserved hypothetical protein; putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  26.67 
 
 		 397 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0510959  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2662  hypothetical protein  29.52 
 
 		 400 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.752873  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6855  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.89 
 
 		 354 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1636  conserved hypothetical protein; putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  29.19 
 
 		 397 aa  46.2  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.564108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2685  hypothetical protein  23.04 
 
 		 399 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0527922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2995  hypothetical protein  27.86 
 
 		 437 aa  45.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674295 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4604  hypothetical protein  26.12 
 
 		 406 aa  44.3  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1797  hypothetical protein  26.6 
 
 		 389 aa  43.1  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0769202  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1603  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  27.75 
 
 		 400 aa  43.1  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.241513  normal  0.216431 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>