33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2537 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2537  hypothetical protein  100 
 
 		 444 aa  907    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.09358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0198  hypothetical protein  50.77 
 
 		 453 aa  461  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0447  hypothetical protein  36.47 
 
 		 401 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000225719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3517  hypothetical protein  35.75 
 
 		 397 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64194  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3716  hypothetical protein  36.43 
 
 		 395 aa  208  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000398757  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0566  hypothetical protein  35.56 
 
 		 393 aa  206  6e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3464  hypothetical protein  35.56 
 
 		 393 aa  206  6e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0565  hypothetical protein  35.56 
 
 		 393 aa  206  7e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3311  hypothetical protein  35.51 
 
 		 394 aa  200  5e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00394375  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3799  hypothetical protein  35.1 
 
 		 394 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0348341  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3142  hypothetical protein  34.5 
 
 		 397 aa  194  4e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.825348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1549  hypothetical protein  30.52 
 
 		 473 aa  193  5e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000145809  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0616  hypothetical protein  34.41 
 
 		 395 aa  193  7e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000317994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4334  hypothetical protein  34.13 
 
 		 403 aa  192  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0527  hypothetical protein  33.58 
 
 		 412 aa  190  4e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000103666  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0526  hypothetical protein  34.09 
 
 		 394 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000343561  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3925  hypothetical protein  34.09 
 
 		 394 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00111259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06466  hypothetical protein  34.11 
 
 		 380 aa  189  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0564  hypothetical protein  35.8 
 
 		 329 aa  187  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3742  hypothetical protein  33.59 
 
 		 394 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.492894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000606  zinc-regulated TonB-dependent outer membrane receptor  33.24 
 
 		 380 aa  185  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000126678  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0052  hypothetical protein  32.69 
 
 		 427 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.567033  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0973  hypothetical protein  30.96 
 
 		 451 aa  161  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0120678  normal  0.0416317 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3053  hypothetical protein  32.03 
 
 		 417 aa  160  5e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0489  hypothetical protein  30.99 
 
 		 496 aa  152  8.999999999999999e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2434  hypothetical protein  30.27 
 
 		 442 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00000516263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1624  hypothetical protein  27.08 
 
 		 410 aa  97.8  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.397158  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1529  hypothetical protein  27.39 
 
 		 410 aa  97.4  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0566823  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3916  hypothetical protein  27.65 
 
 		 466 aa  95.5  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0184862  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1534  hypothetical protein  28.19 
 
 		 409 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.683625 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2340  hypothetical protein  35.62 
 
 		 410 aa  83.6  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.689415  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39270  hypothetical protein  41.33 
 
 		 421 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.981156  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2891  hypothetical protein  21.84 
 
 		 412 aa  43.5  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.687012 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>