31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3142 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_3142  hypothetical protein  100 
 
 
397 aa  811    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.825348  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3716  hypothetical protein  72.82 
 
 
395 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000398757  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3517  hypothetical protein  70.6 
 
 
397 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64194  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0447  hypothetical protein  71.68 
 
 
401 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000225719  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3799  hypothetical protein  67.74 
 
 
394 aa  569  1e-161  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0348341  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4334  hypothetical protein  70.65 
 
 
403 aa  568  1e-161  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0566  hypothetical protein  68.26 
 
 
393 aa  559  1e-158  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3464  hypothetical protein  68.26 
 
 
393 aa  559  1e-158  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0565  hypothetical protein  68.51 
 
 
393 aa  560  1e-158  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3742  hypothetical protein  67.58 
 
 
394 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.492894  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3311  hypothetical protein  68.53 
 
 
394 aa  553  1e-156  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00394375  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3925  hypothetical protein  67.25 
 
 
394 aa  554  1e-156  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00111259  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0526  hypothetical protein  67.25 
 
 
394 aa  554  1e-156  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000343561  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0616  hypothetical protein  71.61 
 
 
395 aa  550  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000317994  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0527  hypothetical protein  66.18 
 
 
412 aa  549  1e-155  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000103666  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0564  hypothetical protein  70.71 
 
 
329 aa  513  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06466  hypothetical protein  51.87 
 
 
380 aa  385  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000606  zinc-regulated TonB-dependent outer membrane receptor  51.12 
 
 
380 aa  380  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000126678  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2537  hypothetical protein  35.31 
 
 
444 aa  204  2e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.09358  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0198  hypothetical protein  34.52 
 
 
453 aa  199  6e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0973  hypothetical protein  28.77 
 
 
451 aa  152  7e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0120678  normal  0.0416317 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0489  hypothetical protein  31.93 
 
 
496 aa  145  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2434  hypothetical protein  31.58 
 
 
442 aa  142  7e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00000516263  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3053  hypothetical protein  30.89 
 
 
417 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1549  hypothetical protein  27.23 
 
 
473 aa  114  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000145809  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0052  hypothetical protein  28.5 
 
 
427 aa  106  7e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.567033  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1624  hypothetical protein  25.71 
 
 
410 aa  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.397158  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1529  hypothetical protein  25.42 
 
 
410 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0566823  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1534  hypothetical protein  26.72 
 
 
409 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.683625 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2340  hypothetical protein  36.04 
 
 
410 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.689415  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3916  hypothetical protein  24.6 
 
 
466 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0184862  normal  0.0893637 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>