31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3517 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3517  hypothetical protein  100 
 
 		 397 aa  818    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64194  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3799  hypothetical protein  77.56 
 
 		 394 aa  633  1e-180  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0348341  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0566  hypothetical protein  76.62 
 
 		 393 aa  624  1e-178  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3464  hypothetical protein  76.62 
 
 		 393 aa  624  1e-178  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3311  hypothetical protein  76.5 
 
 		 394 aa  620  1e-177  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00394375  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3742  hypothetical protein  76.56 
 
 		 394 aa  622  1e-177  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.492894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0565  hypothetical protein  76.37 
 
 		 393 aa  622  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3925  hypothetical protein  76 
 
 		 394 aa  622  1e-177  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00111259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0526  hypothetical protein  76 
 
 		 394 aa  622  1e-177  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000343561  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3716  hypothetical protein  73.3 
 
 		 395 aa  597  1e-169  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000398757  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0447  hypothetical protein  70.9 
 
 		 401 aa  586  1e-166  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000225719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0527  hypothetical protein  69.51 
 
 		 412 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000103666  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4334  hypothetical protein  71.04 
 
 		 403 aa  580  1e-164  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0616  hypothetical protein  72.75 
 
 		 395 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000317994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3142  hypothetical protein  72.15 
 
 		 397 aa  545  1e-154  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.825348  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0564  hypothetical protein  75.3 
 
 		 329 aa  528  1e-149  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000606  zinc-regulated TonB-dependent outer membrane receptor  51.51 
 
 		 380 aa  387  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000126678  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06466  hypothetical protein  52.55 
 
 		 380 aa  388  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2537  hypothetical protein  36.27 
 
 		 444 aa  210  4e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.09358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0198  hypothetical protein  34.58 
 
 		 453 aa  204  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0973  hypothetical protein  31.12 
 
 		 451 aa  153  5e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0120678  normal  0.0416317 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0489  hypothetical protein  31.84 
 
 		 496 aa  147  3e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3053  hypothetical protein  30.11 
 
 		 417 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2434  hypothetical protein  29.49 
 
 		 442 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00000516263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1549  hypothetical protein  27.86 
 
 		 473 aa  126  5e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000145809  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0052  hypothetical protein  29.13 
 
 		 427 aa  119  7.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.567033  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1624  hypothetical protein  24.71 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.397158  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1529  hypothetical protein  25.14 
 
 		 410 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0566823  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3916  hypothetical protein  26.92 
 
 		 466 aa  71.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0184862  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2340  hypothetical protein  24.17 
 
 		 410 aa  66.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.689415  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1534  hypothetical protein  31.76 
 
 		 409 aa  60.1  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.683625 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>