31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0447 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0447  hypothetical protein  100 
 
 		 401 aa  833    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000225719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3716  hypothetical protein  76.46 
 
 		 395 aa  623  1e-177  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000398757  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4334  hypothetical protein  74.69 
 
 		 403 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0565  hypothetical protein  71.96 
 
 		 393 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0616  hypothetical protein  75.93 
 
 		 395 aa  598  1e-170  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000317994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0566  hypothetical protein  71.71 
 
 		 393 aa  599  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3464  hypothetical protein  71.71 
 
 		 393 aa  599  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3517  hypothetical protein  71.07 
 
 		 397 aa  599  1e-170  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64194  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3799  hypothetical protein  69.68 
 
 		 394 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0348341  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3311  hypothetical protein  71.29 
 
 		 394 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00394375  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3925  hypothetical protein  69.63 
 
 		 394 aa  578  1e-164  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00111259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0526  hypothetical protein  69.63 
 
 		 394 aa  578  1e-164  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000343561  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3742  hypothetical protein  69.38 
 
 		 394 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.492894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3142  hypothetical protein  72.53 
 
 		 397 aa  551  1e-156  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.825348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0527  hypothetical protein  64.42 
 
 		 412 aa  535  1e-151  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000103666  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0564  hypothetical protein  73.13 
 
 		 329 aa  523  1e-147  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06466  hypothetical protein  53.44 
 
 		 380 aa  390  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000606  zinc-regulated TonB-dependent outer membrane receptor  52.93 
 
 		 380 aa  387  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000126678  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0198  hypothetical protein  36.22 
 
 		 453 aa  217  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2537  hypothetical protein  37.78 
 
 		 444 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.09358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0489  hypothetical protein  29.82 
 
 		 496 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0973  hypothetical protein  27.92 
 
 		 451 aa  138  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0120678  normal  0.0416317 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2434  hypothetical protein  31.03 
 
 		 442 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00000516263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1549  hypothetical protein  27.51 
 
 		 473 aa  123  7e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000145809  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3053  hypothetical protein  30.96 
 
 		 417 aa  120  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0052  hypothetical protein  28.42 
 
 		 427 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.567033  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1624  hypothetical protein  26.03 
 
 		 410 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.397158  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1529  hypothetical protein  26.03 
 
 		 410 aa  70.1  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0566823  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2340  hypothetical protein  25 
 
 		 410 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.689415  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3916  hypothetical protein  25.81 
 
 		 466 aa  56.6  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0184862  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1534  hypothetical protein  35.14 
 
 		 409 aa  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.683625 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>