153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1909 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1909  colicin V production protein  100 
 
 		 163 aa  304  3e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.485501 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1693  colicin V production protein  36.81 
 
 		 163 aa  103  7e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.339173 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1977  colicin V production transmembrane protein  35.8 
 
 		 165 aa  94  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.16947 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1907  colicin V production protein  32.7 
 
 		 174 aa  93.2  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1807  Colicin V production protein  36.42 
 
 		 165 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3760  Colicin V production protein  35.22 
 
 		 161 aa  87  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0367363  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2300  colicin V production protein  36.42 
 
 		 171 aa  86.7  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.113958  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1606  colicin V production protein  35.76 
 
 		 161 aa  85.5  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1091  colicin V production protein  32.7 
 
 		 161 aa  84.3  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.527466 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0875  colicin V production protein  35.98 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.592724  normal  0.0357413 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2152  colicin V production protein  32.92 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.925685  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2490  CvpA family protein  37.5 
 
 		 177 aa  79.7  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.904842  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4616  colicin V production protein  33.73 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2227  Colicin V production protein  35.62 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.630839  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2737  colicin V production protein  35.62 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2131  Colicin V production protein  36.42 
 
 		 165 aa  77.4  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.519275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1329  Colicin V production protein  30.63 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0804105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2875  putative bacteriocin production related protein  33.12 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1154  Colicin V production protein  29.81 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.418061  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4770  colicin V production protein  29.38 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161022 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3372  colicin V production protein  34.38 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00676354  normal  0.15838 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2047  colicin V production protein  32.61 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.220439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2119  colicin V production protein  35.54 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.73318  normal  0.0950051 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2461  colicin V production protein  30.67 
 
 		 165 aa  67  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.400499  normal  0.228634 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2684  colicin V production protein  36.62 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6836  Colicin V production protein  33.12 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.612916 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1298  hypothetical protein  32.09 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1297  hypothetical protein  32.09 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1258  Colicin V production protein  33.1 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0685  CvpA family protein  35.54 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.345398  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3564  colicin V production protein  34.34 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4403  colicin V production protein  34.34 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.454399  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3964  colicin V production protein  34.34 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02505  colicin V production protein  33.57 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.785902  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1715  CvpA family protein  34.34 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3354  colicin V production protein  34.36 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0663199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4380  colicin V production protein  32.52 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1655  CvpA family protein  34.34 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.984666  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1864  CvpA family protein  34.34 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2439  CvpA family protein  34.34 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.267781  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0535  CvpA family protein  34.34 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3859  colicin V production protein  34.36 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0763  CvpA family protein  34.34 
 
 		 164 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1102  colicin V production protein  32.87 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.374563 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1241  colicin V production protein  33.8 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.599135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2301  CvpA family protein  34.34 
 
 		 164 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2073  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 component  28.26 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.576692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1553  colicin V production protein  28.36 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0745627  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1608  colicin V production protein  35.97 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1283  colicin V production protein  30.77 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.797864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0524  bacteriocin production protein  30.43 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00361211  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1672  colicin V production protein  24.55 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0917  colicin V production protein  32.12 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1966  colicin V production protein  28.78 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.530952 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1723  Colicin V production protein  30.88 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.558498  normal  0.0591031 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2065  CvpA family protein  30.88 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2162  colicin V production protein  32.74 
 
 		 193 aa  57.4  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.340208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3057  Colicin V production protein  32.32 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0780  colicin V production protein  31.74 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1079  colicin V production protein (protein DedE)  30.43 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1799  colicin V production protein  44.23 
 
 		 187 aa  54.3  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.503822  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1266  colicin V production protein  32.64 
 
 		 198 aa  53.5  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.488094  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05660  Colicin V production protein  29.63 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0935  colicin V production protein  30.91 
 
 		 183 aa  53.1  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1398  colicin V production protein  28.26 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3799  colicin V production protein  29.71 
 
 		 160 aa  51.6  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1558  cvpA family protein  30.92 
 
 		 190 aa  51.6  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.383217  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2794  colicin V production protein  27.54 
 
 		 166 aa  51.6  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0405  colicin V production protein  30.43 
 
 		 236 aa  51.2  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1620  colicin V production protein  28.99 
 
 		 162 aa  51.2  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4093  colicin V production protein  34.51 
 
 		 189 aa  50.8  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.799722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1489  colicin V production protein  28.26 
 
 		 166 aa  50.8  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000231949  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1687  colicin V production protein  31.88 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2712  colicin V production protein  29.93 
 
 		 170 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240429  normal  0.143429 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1999  colicin V production protein  28.97 
 
 		 185 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1862  colicin V production protein  33.33 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.526442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3762  colicin V production protein  28.97 
 
 		 185 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1533  colicin V production protein  28.97 
 
 		 185 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3329  colicin V production protein  27.54 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1470  colicin V production protein  26.81 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0448  cvpA family protein  29.8 
 
 		 187 aa  48.5  0.00004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.179388  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2303  colicin V production protein  28.26 
 
 		 162 aa  48.5  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0777  colicin V production protein  31.25 
 
 		 188 aa  48.5  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136777  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0510  Colicin V production protein  30.63 
 
 		 190 aa  48.5  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.103168  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0422  cvpA family protein  29.8 
 
 		 187 aa  48.1  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00865734  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1044  Colicin V production protein  25.6 
 
 		 188 aa  48.1  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.572812 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1655  colicin V production protein  28.26 
 
 		 162 aa  48.1  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00513231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0367  CvpA family protein  24.64 
 
 		 161 aa  47.8  0.00006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.202665  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0552  Colicin V production protein  34.21 
 
 		 162 aa  47.8  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1560  colicin V production protein  28.28 
 
 		 185 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.328677  normal  0.213335 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0356  Colicin V production protein  32.23 
 
 		 169 aa  47.8  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2194  Colicin V production protein  36.7 
 
 		 186 aa  47.4  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23900  hypothetical protein  29.58 
 
 		 180 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00157781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2024  hypothetical protein  29.58 
 
 		 184 aa  47.4  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1667  colicin V production protein  25.37 
 
 		 195 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1429  colicin V production protein  27.54 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.550584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1494  colicin V production protein  27.54 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1482  colicin V production protein  27.54 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.842254 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1024  colicin V production protein  29.17 
 
 		 195 aa  46.6  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1343  Colicin V production protein  26.09 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0732005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>