22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1843 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_1843  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  346  7e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2493  hypothetical protein  33.12 
 
 
174 aa  85.5  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.256462  normal  0.792033 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1053  hypothetical protein  31.97 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  0.267344 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2158  hypothetical protein  27.54 
 
 
163 aa  59.3  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1760  Domain of unknown function DUF1791  28.89 
 
 
166 aa  58.2  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289316  normal  0.172768 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0509  hypothetical protein  30.36 
 
 
165 aa  58.2  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0289752  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2490  hypothetical protein  31.85 
 
 
161 aa  56.6  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0065  hypothetical protein  30.08 
 
 
112 aa  48.9  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0504  hypothetical protein  29.31 
 
 
154 aa  47.4  0.00009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0536  hypothetical protein  41.38 
 
 
123 aa  47.4  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1221  hypothetical protein  26.77 
 
 
127 aa  47  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0093  hypothetical protein  28.57 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1472  hypothetical protein  25.76 
 
 
151 aa  46.2  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00198336  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1398  domain of unknown function DUF1791  25 
 
 
150 aa  45.1  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2602  hypothetical protein  28.46 
 
 
115 aa  44.7  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00587907  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2301  Domain of unknown function DUF1791  28.99 
 
 
162 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.583301  normal  0.0480111 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4145  protein of unknown function DUF1791  28.66 
 
 
153 aa  42.4  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1599  hypothetical protein  27.17 
 
 
190 aa  42.4  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.163605  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2392  hypothetical protein  30.3 
 
 
181 aa  42.4  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0256  hypothetical protein  28.85 
 
 
154 aa  42  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0557189  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0564  hypothetical protein  25.74 
 
 
147 aa  41.6  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0691  Domain of unknown function DUF1791  23.85 
 
 
146 aa  40.8  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0623346 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>