37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1693 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1693  hypothetical protein  100 
 
 		 830 aa  1712    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.349675  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2858  hypothetical protein  46.05 
 
 		 835 aa  641    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2253  subtilisin-like serine protease  42.28 
 
 		 823 aa  605  1.0000000000000001e-171  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1292  hypothetical protein  43.18 
 
 		 841 aa  593  1e-168  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886595 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4275  hypothetical protein  41.61 
 
 		 826 aa  595  1e-168  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4230  hypothetical protein  43.63 
 
 		 789 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.828103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2676  hypothetical protein  42.99 
 
 		 822 aa  550  1e-155  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.70915 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4804  hypothetical protein  40 
 
 		 831 aa  536  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5328  hypothetical protein  38.22 
 
 		 829 aa  531  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355422  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1586  hypothetical protein  36.54 
 
 		 847 aa  518  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3864  hypothetical protein  35.79 
 
 		 847 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000004588 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0085  hypothetical protein  39.61 
 
 		 849 aa  514  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0321951  normal  0.899584 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3853  hypothetical protein  38.35 
 
 		 845 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2776  subtilisin-like serine protease  37.11 
 
 		 830 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.278125  normal  0.827378 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4253  hypothetical protein  39.47 
 
 		 846 aa  481  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.63096  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1074  hypothetical protein  38.14 
 
 		 825 aa  478  1e-133  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0387  Y4bN protein  36.41 
 
 		 814 aa  452  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0549817  normal  0.142123 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4893  hypothetical protein  38.73 
 
 		 835 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3670  hypothetical protein  36.11 
 
 		 851 aa  373  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.758768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3535  hypothetical protein  34.27 
 
 		 850 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.692569  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2088  hypothetical protein  32.63 
 
 		 847 aa  351  2e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5488  hypothetical protein  33.18 
 
 		 847 aa  346  8e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4416  hypothetical protein  38.36 
 
 		 472 aa  302  2e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.710672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4413  hypothetical protein  45.48 
 
 		 376 aa  301  3e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0448  hypothetical protein  25.08 
 
 		 712 aa  110  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3322  S8A family peptidase  26.59 
 
 		 795 aa  97.1  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.546962  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3504  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26 
 
 		 827 aa  94.7  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.227841  normal  0.192563 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2639  hypothetical protein  22.45 
 
 		 821 aa  68.2  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0443804  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3795  hypothetical protein  23.11 
 
 		 740 aa  57.8  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.542831  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3058  hypothetical protein  23.18 
 
 		 790 aa  57.4  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2443  hypothetical protein  23.64 
 
 		 739 aa  53.1  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5900  hypothetical protein  25.85 
 
 		 792 aa  51.6  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1641  Subtilisin-like serine protease protein  25.19 
 
 		 570 aa  50.8  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3739  hypothetical protein  24.21 
 
 		 740 aa  47.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5977  hypothetical protein  26.76 
 
 		 844 aa  45.4  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5574  hypothetical protein  26.76 
 
 		 844 aa  45.4  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.218076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5697  hypothetical protein  21.97 
 
 		 737 aa  44.3  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405224 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>