81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1078 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1078  hypothetical protein  100 
 
 
340 aa  682    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000182867  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0568  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.65 
 
 
353 aa  77.4  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000504659  normal  0.286887 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1512  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  20.49 
 
 
355 aa  70.1  0.00000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00064667  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1861  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.43 
 
 
340 aa  64.7  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1727  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.97 
 
 
607 aa  64.3  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000786777  normal  0.037672 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21140  peptidil-prolyl cis-trans isomerase  26.06 
 
 
332 aa  63.5  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0112  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.69 
 
 
344 aa  63.2  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000942479  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4334  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.23 
 
 
317 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0815  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.89 
 
 
339 aa  62.8  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000256558  decreased coverage  0.00000000715296 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4489  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.31 
 
 
317 aa  62.8  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0659  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.91 
 
 
324 aa  62.4  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2605  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.2 
 
 
326 aa  61.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4470  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24 
 
 
317 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0911  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.59 
 
 
354 aa  60.1  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.159559  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2740  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.65 
 
 
335 aa  57.4  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000934934  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2806  peptidylprolyl isomerase  22 
 
 
342 aa  57.4  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2908  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.53 
 
 
341 aa  57.4  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000327787  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0729  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.26 
 
 
314 aa  56.6  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2429  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  24.51 
 
 
351 aa  56.2  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00328792  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4068  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.14 
 
 
600 aa  56.2  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000254866  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0015  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.88 
 
 
329 aa  55.8  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0015  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.88 
 
 
329 aa  55.8  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3064  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase D)  24.38 
 
 
626 aa  55.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0594  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.92 
 
 
301 aa  55.8  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11600  parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase  36.67 
 
 
404 aa  55.8  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.129184  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4480  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.43 
 
 
317 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.284455 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12160  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.13 
 
 
495 aa  55.1  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000838067  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1933  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.43 
 
 
628 aa  54.7  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0320935  normal  0.229226 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1709  hypothetical protein  30.26 
 
 
526 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.98029e-32 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0157  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.8 
 
 
317 aa  54.3  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.194598  hitchhiker  0.00636853 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0806  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.83 
 
 
458 aa  53.9  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.938521  normal  0.646398 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2867  hypothetical protein  25.35 
 
 
525 aa  53.1  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000295724  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2452  SurA domain-containing protein  25.34 
 
 
213 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.276883  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0917  hypothetical protein  27.6 
 
 
549 aa  51.2  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00123306  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0599  hypothetical protein  26.7 
 
 
524 aa  50.8  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.674493  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1508  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase D  27.57 
 
 
619 aa  50.8  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000293924  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0699  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.39 
 
 
305 aa  51.2  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000032571  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1623  hypothetical protein  19.68 
 
 
522 aa  50.8  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.74057  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2492  peptidylprolyl isomerase  23.29 
 
 
342 aa  50.1  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0014  SurA domain  19.94 
 
 
439 aa  50.1  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.86378  hitchhiker  0.00063854 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3548  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.56 
 
 
323 aa  50.1  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000137747  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0141  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.39 
 
 
310 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000469336  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0540  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  19.15 
 
 
522 aa  48.1  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2510  hypothetical protein  28.19 
 
 
526 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000182478  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2042  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25 
 
 
602 aa  48.1  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2077  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  20 
 
 
321 aa  47.4  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0105  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase surA  20 
 
 
321 aa  47.8  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.507131  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3485  hypothetical protein  24.83 
 
 
213 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.129605  normal  0.615031 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0914  major antigenic peptide PEB-cell binding factor  27.35 
 
 
271 aa  47.4  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.617147  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0823  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase D  23.39 
 
 
618 aa  47.4  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0677153  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0103  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.06 
 
 
632 aa  47  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.199337  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5240  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25 
 
 
390 aa  47  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1416  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.71 
 
 
352 aa  47  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.146032  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2286  SurA domain-containing protein  25 
 
 
213 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.266195  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0912  SurA domain protein  27.5 
 
 
311 aa  46.2  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.557148  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3480  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25 
 
 
326 aa  46.2  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.240532  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2054  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.16 
 
 
615 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000102165  normal  0.112605 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1772  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.69 
 
 
626 aa  45.8  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.546992  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0215  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.23 
 
 
327 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.750083  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1715  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase transmembrane protein  22.54 
 
 
648 aa  45.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0289129  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3035  survival protein SurA  24.48 
 
 
436 aa  45.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0785  hypothetical protein  24.76 
 
 
445 aa  45.1  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.954902 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0016  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  25.62 
 
 
313 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000161985  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0639  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.3 
 
 
335 aa  44.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.143163  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3588  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.71 
 
 
300 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000961276  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3046  hypothetical protein  27.13 
 
 
531 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00301389  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2644  SurA domain  24.48 
 
 
477 aa  45.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1836  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.51 
 
 
617 aa  44.3  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.900571  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0089  parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase  23.28 
 
 
316 aa  44.7  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.322667  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4875  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.48 
 
 
342 aa  44.3  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163998  normal  0.150667 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0028  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  31.54 
 
 
438 aa  43.9  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0719  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.8 
 
 
350 aa  43.9  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0699  major antigenic peptide PEB4  25 
 
 
273 aa  43.9  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1073  major antigenic peptide PEB4  25 
 
 
273 aa  43.5  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.364345  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0146  hypothetical protein  23.65 
 
 
278 aa  43.5  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0022721  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0624  major antigenic peptide PEB4  25 
 
 
273 aa  43.5  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.796304  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0142  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.42 
 
 
345 aa  43.1  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2461  hypothetical protein  23.78 
 
 
213 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.224867  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3549  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.11 
 
 
333 aa  42.7  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000983589  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1449  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.03 
 
 
640 aa  42.7  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.084386  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1613  SurA domain  29.29 
 
 
255 aa  42.7  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000247502  unclonable  3.15321e-23 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>