33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1026 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1026  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  100 
 
 		 812 aa  1672    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1658  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  34.83 
 
 		 731 aa  336  7.999999999999999e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0627  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  28.62 
 
 		 977 aa  149  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.397763  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2979  CRISPR-associated protein, Crm2 family  23.73 
 
 		 623 aa  114  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.113889 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3380  CRISPR-associated protein, Cmr3  25.19 
 
 		 494 aa  109  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.879462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15150  CRISPR-associated protein, Crm2 family  31.23 
 
 		 676 aa  105  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0964  CRISPR-associated Cmr2 family protein  36.36 
 
 		 477 aa  93.6  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.662431  normal  0.765777 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0700  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  35.32 
 
 		 616 aa  93.6  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00738894  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1823  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  35.75 
 
 		 607 aa  93.6  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1484  Cmr2 family CRISPR-associated protein  30.81 
 
 		 488 aa  92  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.752806  normal  0.296807 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0316  CRISPR-associated protein, Crm2 family  30.22 
 
 		 548 aa  89  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.182847  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1118  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  30.98 
 
 		 878 aa  85.1  0.000000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0658  CRISPR-associated protein, Crm2 family  31 
 
 		 569 aa  84.3  0.000000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1284  CRISPR-associated Cmr2 family protein  28.69 
 
 		 874 aa  80.9  0.00000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0368664 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1194  CRISPR-associated protein, Crm2 family  32.16 
 
 		 546 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0272  CRISPR-associated Cmr2 family protein  25 
 
 		 935 aa  73.6  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1316  hypothetical protein  25.88 
 
 		 978 aa  72  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.800539  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2297  CRISPR-associated protein, Crm2 family  26.45 
 
 		 616 aa  69.3  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0263  CRISPR-associated Cmr2 family protein  28.19 
 
 		 629 aa  68.6  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1518  hypothetical protein  27.59 
 
 		 1045 aa  68.2  0.0000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0649  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  30.99 
 
 		 638 aa  63.5  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2692  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  30.13 
 
 		 612 aa  62.4  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1951  CRISPR-associated protein, Crm2 family  25.72 
 
 		 624 aa  60.8  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0579  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  25.81 
 
 		 628 aa  56.6  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.638626  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2384  Crm2 family CRISPR-associated protein  23.5 
 
 		 776 aa  50.8  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.751103  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0563  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  29.6 
 
 		 898 aa  49.3  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.406769  hitchhiker  0.00098252 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1317  CRISPR-associated protein, Crm2 family  25.95 
 
 		 650 aa  49.3  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1791  CRISPR-associated protein, Crm2 family  27.96 
 
 		 637 aa  48.1  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.175791  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0106  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  23.9 
 
 		 528 aa  48.1  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12837  hypothetical protein  20.57 
 
 		 812 aa  47  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.867182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1097  metal dependent phosphohydrolase  26.01 
 
 		 735 aa  47  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0745  metal dependent phosphohydrolase  27.18 
 
 		 823 aa  45.8  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.196363  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  28.18 
 
 		 1523 aa  45.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>