48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0265 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0265  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  294  3e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0984626  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0267  hypothetical protein  91.61 
 
 		 143 aa  272  1.0000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0194677  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0815  hypothetical protein  48.67 
 
 		 127 aa  98.6  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0356  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  39.13 
 
 		 356 aa  87  7e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0334689  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1424  hypothetical protein  37.98 
 
 		 138 aa  85.1  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.149794  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1071  hypothetical protein  38.26 
 
 		 356 aa  85.1  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.661198  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1555  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  38.26 
 
 		 356 aa  84.3  5e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.272014 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0628  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  43.22 
 
 		 357 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1691  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  39.13 
 
 		 356 aa  79.3  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0507  hypothetical protein  37.07 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0319472  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1462  protein of unknown function DUF123  34.78 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0479  protein of unknown function DUF123  33.59 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0625  hypothetical protein  35.24 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0654  protein of unknown function DUF123  34.75 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0937  protein of unknown function DUF123  34.23 
 
 		 128 aa  60.1  0.000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.305351  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0898  protein of unknown function DUF123  33.09 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0253075  normal  0.780245 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3196  protein of unknown function DUF123  37.39 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0198  hypothetical protein  34.15 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000406548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02280  hypothetical protein  35.14 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273401  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1482  hypothetical protein  32.77 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0956236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2461  hypothetical protein  35.54 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1312  hypothetical protein  30.23 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.474029 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2695  hypothetical protein  38.66 
 
 		 188 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0278  protein of unknown function DUF123  29.31 
 
 		 125 aa  53.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0991873  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0646  hypothetical protein  32.69 
 
 		 154 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.269467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0792  hypothetical protein  29.9 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0013461 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1038  hypothetical protein  32.38 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4343 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1958  hypothetical protein  29.84 
 
 		 115 aa  51.2  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1807  hypothetical protein  31.82 
 
 		 134 aa  50.4  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0796576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3380  protein of unknown function DUF123  34.48 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.798744  normal  0.147915 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0067  hypothetical protein  31.2 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1962  hypothetical protein  30.61 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0360  hypothetical protein  29.87 
 
 		 197 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0611863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1232  hypothetical protein  34.19 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0396  endonuclease III  26.72 
 
 		 174 aa  48.9  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0260  hypothetical protein  28.31 
 
 		 197 aa  48.9  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0029368  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0871  hypothetical protein  29.09 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0042  hypothetical protein  28.97 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.899596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0747  hypothetical protein  30.09 
 
 		 168 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0334  hypothetical protein  28.14 
 
 		 208 aa  46.2  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.804201  normal  0.829767 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0776  protein of unknown function DUF123  32.98 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0858  hypothetical protein  43.94 
 
 		 165 aa  44.3  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0338  hypothetical protein  25.15 
 
 		 189 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0278088  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2572  hypothetical protein  34.91 
 
 		 126 aa  43.5  0.0009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1211  hypothetical protein  27.61 
 
 		 189 aa  43.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.174889  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1123  hypothetical protein  28.4 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2610  hypothetical protein  28.57 
 
 		 192 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0578  protein of unknown function DUF123  27.27 
 
 		 133 aa  42  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>