25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1482 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1482  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  247  5e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0956236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1958  hypothetical protein  46.49 
 
 		 115 aa  90.5  7e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0871  hypothetical protein  46.09 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0792  hypothetical protein  39.47 
 
 		 135 aa  88.2  3e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0013461 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0937  protein of unknown function DUF123  39.09 
 
 		 128 aa  85.1  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.305351  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1962  hypothetical protein  43.93 
 
 		 119 aa  82  0.000000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0265  hypothetical protein  32.77 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0984626  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0578  protein of unknown function DUF123  34.29 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0267  hypothetical protein  32.77 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0194677  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1424  hypothetical protein  31.53 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.149794  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1071  hypothetical protein  34.48 
 
 		 356 aa  51.6  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.661198  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1555  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34.48 
 
 		 356 aa  50.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.272014 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0356  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  35.29 
 
 		 356 aa  50.1  0.000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0334689  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0815  hypothetical protein  37.97 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1312  hypothetical protein  35.63 
 
 		 162 aa  49.7  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.474029 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0654  protein of unknown function DUF123  39.51 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0479  protein of unknown function DUF123  35.45 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1691  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  37.04 
 
 		 356 aa  45.4  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02280  hypothetical protein  34.12 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273401  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0628  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  35.44 
 
 		 357 aa  41.2  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0747  hypothetical protein  36.47 
 
 		 168 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2572  hypothetical protein  35.56 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0396  endonuclease III  37.21 
 
 		 174 aa  40.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0278  protein of unknown function DUF123  36.14 
 
 		 125 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0991873  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0646  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.269467  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>