28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0260 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0260  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  406  1e-113  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0029368  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2610  hypothetical protein  49.21 
 
 		 192 aa  185  3e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0338  hypothetical protein  44.74 
 
 		 189 aa  173  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0278088  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1211  hypothetical protein  45.11 
 
 		 189 aa  154  1e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.174889  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0360  hypothetical protein  45.05 
 
 		 197 aa  153  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0611863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0334  hypothetical protein  44.64 
 
 		 208 aa  148  4e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.804201  normal  0.829767 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1924  hypothetical protein  40.68 
 
 		 191 aa  131  6.999999999999999e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1232  hypothetical protein  31.41 
 
 		 164 aa  57.4  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0858  hypothetical protein  30.34 
 
 		 165 aa  54.7  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1462  protein of unknown function DUF123  27.54 
 
 		 142 aa  51.6  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0267  hypothetical protein  28.92 
 
 		 143 aa  50.8  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0194677  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2695  hypothetical protein  29.49 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0628  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.88 
 
 		 357 aa  49.3  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0265  hypothetical protein  28.31 
 
 		 143 aa  48.9  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0984626  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0198  hypothetical protein  25 
 
 		 144 aa  48.9  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000406548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0898  protein of unknown function DUF123  31.86 
 
 		 137 aa  48.5  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0253075  normal  0.780245 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1038  hypothetical protein  28.65 
 
 		 146 aa  45.8  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4343 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3380  protein of unknown function DUF123  29.49 
 
 		 153 aa  44.7  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.798744  normal  0.147915 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0625  hypothetical protein  24.53 
 
 		 119 aa  44.7  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02280  hypothetical protein  27.92 
 
 		 138 aa  44.7  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273401  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3196  protein of unknown function DUF123  28.07 
 
 		 141 aa  44.3  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1424  hypothetical protein  24.12 
 
 		 138 aa  43.9  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.149794  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0654  protein of unknown function DUF123  25.15 
 
 		 136 aa  43.5  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1071  hypothetical protein  25.97 
 
 		 356 aa  43.1  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.661198  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1691  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.52 
 
 		 356 aa  42  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0815  hypothetical protein  25.78 
 
 		 127 aa  41.6  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1312  hypothetical protein  25.14 
 
 		 162 aa  41.6  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.474029 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0507  hypothetical protein  25.32 
 
 		 139 aa  41.6  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0319472  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>