29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0338 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0338  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  387  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0278088  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2610  hypothetical protein  48.15 
 
 
192 aa  189  1e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0260  hypothetical protein  44.74 
 
 
197 aa  173  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0029368  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1211  hypothetical protein  41.27 
 
 
189 aa  161  5.0000000000000005e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.174889  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0360  hypothetical protein  44.32 
 
 
197 aa  150  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0611863  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1924  hypothetical protein  40.88 
 
 
191 aa  149  3e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0334  hypothetical protein  41.34 
 
 
208 aa  135  3.0000000000000003e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.804201  normal  0.829767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1232  hypothetical protein  33.55 
 
 
164 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2695  hypothetical protein  30.97 
 
 
188 aa  62.4  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3380  protein of unknown function DUF123  32.48 
 
 
153 aa  60.5  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.798744  normal  0.147915 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0198  hypothetical protein  27.22 
 
 
144 aa  55.1  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000406548  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1071  hypothetical protein  26.28 
 
 
356 aa  51.6  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.661198  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1462  protein of unknown function DUF123  27.61 
 
 
142 aa  51.2  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0356  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.03 
 
 
356 aa  51.6  0.000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0334689  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1555  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.03 
 
 
356 aa  50.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.272014 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0898  protein of unknown function DUF123  24.7 
 
 
137 aa  50.1  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0253075  normal  0.780245 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0625  hypothetical protein  26.88 
 
 
119 aa  49.3  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1424  hypothetical protein  26.14 
 
 
138 aa  47.8  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.149794  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0858  hypothetical protein  27.12 
 
 
165 aa  46.6  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0628  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  24.18 
 
 
357 aa  45.4  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0815  hypothetical protein  26.51 
 
 
127 aa  45.4  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0265  hypothetical protein  25.15 
 
 
143 aa  43.9  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0984626  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0654  protein of unknown function DUF123  29.1 
 
 
136 aa  44.3  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1691  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  25.49 
 
 
356 aa  43.9  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1312  hypothetical protein  23.7 
 
 
162 aa  43.1  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.474029 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0507  hypothetical protein  25.14 
 
 
139 aa  42.4  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0319472  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0267  hypothetical protein  25.15 
 
 
143 aa  42  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0194677  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0578  protein of unknown function DUF123  24.56 
 
 
133 aa  41.6  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02280  hypothetical protein  25.71 
 
 
138 aa  41.2  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>