22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0334 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0334  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  431  1e-120  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.804201  normal  0.829767 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0360  hypothetical protein  45.74 
 
 
197 aa  158  6e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0611863  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2610  hypothetical protein  44.13 
 
 
192 aa  157  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0260  hypothetical protein  44.64 
 
 
197 aa  148  5e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0029368  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0338  hypothetical protein  41.34 
 
 
189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0278088  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1211  hypothetical protein  42.42 
 
 
189 aa  130  9e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.174889  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1924  hypothetical protein  41.34 
 
 
191 aa  122  5e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0628  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.48 
 
 
357 aa  58.2  0.00000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0815  hypothetical protein  26.32 
 
 
127 aa  58.2  0.00000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1424  hypothetical protein  26.4 
 
 
138 aa  53.5  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.149794  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1071  hypothetical protein  25.48 
 
 
356 aa  53.1  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.661198  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1462  protein of unknown function DUF123  26.71 
 
 
142 aa  52  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1555  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  24.84 
 
 
356 aa  50.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.272014 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1691  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.04 
 
 
356 aa  49.3  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0356  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  24.2 
 
 
356 aa  48.9  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0334689  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0267  hypothetical protein  26.95 
 
 
143 aa  47  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0194677  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02280  hypothetical protein  27.78 
 
 
138 aa  47  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273401  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3380  protein of unknown function DUF123  28.41 
 
 
153 aa  46.2  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.798744  normal  0.147915 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0265  hypothetical protein  28.14 
 
 
143 aa  46.2  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0984626  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0198  hypothetical protein  24.69 
 
 
144 aa  45.4  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000406548  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1038  hypothetical protein  28.9 
 
 
146 aa  43.1  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.4343 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0479  protein of unknown function DUF123  26.09 
 
 
134 aa  41.6  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>