44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0198 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0198  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  299  1e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000406548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0396  endonuclease III  49.25 
 
 		 174 aa  139  9e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0414  protein of unknown function DUF123  52.94 
 
 		 144 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.434904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0042  hypothetical protein  48.57 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.899596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2461  hypothetical protein  44.7 
 
 		 148 aa  124  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0051  hypothetical protein  50 
 
 		 151 aa  111  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0898  protein of unknown function DUF123  42.5 
 
 		 137 aa  104  5e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0253075  normal  0.780245 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0507  hypothetical protein  41.94 
 
 		 139 aa  103  6e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0319472  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3196  protein of unknown function DUF123  36.22 
 
 		 141 aa  89.4  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0654  protein of unknown function DUF123  37.04 
 
 		 136 aa  88.2  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1071  hypothetical protein  37.19 
 
 		 356 aa  80.9  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.661198  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1462  protein of unknown function DUF123  36.36 
 
 		 142 aa  80.1  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1555  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  35.54 
 
 		 356 aa  78.2  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.272014 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1312  hypothetical protein  31.25 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.474029 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0356  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  35.83 
 
 		 356 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0334689  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0628  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34.71 
 
 		 357 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0625  hypothetical protein  34.71 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2695  hypothetical protein  37.69 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3380  protein of unknown function DUF123  40.8 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.798744  normal  0.147915 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02280  hypothetical protein  35.25 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273401  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0479  protein of unknown function DUF123  35.29 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1232  hypothetical protein  34.62 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1691  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  33.06 
 
 		 356 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0858  hypothetical protein  37.41 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1038  hypothetical protein  37.7 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4343 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0578  protein of unknown function DUF123  34.45 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0747  hypothetical protein  31.94 
 
 		 168 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0278  protein of unknown function DUF123  34.75 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0991873  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1807  hypothetical protein  35.14 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0796576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0646  hypothetical protein  36.13 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.269467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1123  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0265  hypothetical protein  34.15 
 
 		 143 aa  57  0.00000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0984626  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0776  protein of unknown function DUF123  35.51 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1211  hypothetical protein  28 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.174889  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2572  hypothetical protein  33.33 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0338  hypothetical protein  27.22 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0278088  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1424  hypothetical protein  30.51 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.149794  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0267  hypothetical protein  32.52 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0194677  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0815  hypothetical protein  28.1 
 
 		 127 aa  50.1  0.000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0260  hypothetical protein  25 
 
 		 197 aa  48.9  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0029368  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0067  hypothetical protein  32.79 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0937  protein of unknown function DUF123  35 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.305351  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0334  hypothetical protein  24.69 
 
 		 208 aa  45.4  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.804201  normal  0.829767 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1962  hypothetical protein  31.78 
 
 		 119 aa  41.6  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>