37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0067 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0067  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  276  9e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0747  hypothetical protein  50.4 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0646  hypothetical protein  49.6 
 
 		 154 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.269467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0776  protein of unknown function DUF123  52.94 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0858  hypothetical protein  41.73 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02280  hypothetical protein  35.38 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273401  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0578  protein of unknown function DUF123  35.54 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0278  protein of unknown function DUF123  39.29 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0991873  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1071  hypothetical protein  31.03 
 
 		 356 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.661198  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2572  hypothetical protein  50.53 
 
 		 126 aa  62  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0356  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.9 
 
 		 356 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0334689  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1691  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34.43 
 
 		 356 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3196  protein of unknown function DUF123  38.85 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0628  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.57 
 
 		 357 aa  61.6  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1555  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.9 
 
 		 356 aa  62  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.272014 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0654  protein of unknown function DUF123  31.48 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0507  hypothetical protein  38.14 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0319472  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2695  hypothetical protein  42.4 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1232  hypothetical protein  40.83 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2461  hypothetical protein  32.84 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1807  hypothetical protein  39.77 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0796576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0625  hypothetical protein  26.67 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0479  protein of unknown function DUF123  34.17 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1038  hypothetical protein  42.02 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4343 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0396  endonuclease III  30.95 
 
 		 174 aa  53.9  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1462  protein of unknown function DUF123  36.59 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3380  protein of unknown function DUF123  34.13 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.798744  normal  0.147915 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0815  hypothetical protein  29.25 
 
 		 127 aa  50.4  0.000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0265  hypothetical protein  31.2 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0984626  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0414  protein of unknown function DUF123  40.82 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.434904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0198  hypothetical protein  32.79 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000406548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0042  hypothetical protein  41.76 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.899596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0267  hypothetical protein  29.6 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0194677  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0051  hypothetical protein  40.82 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0898  protein of unknown function DUF123  36.29 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0253075  normal  0.780245 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1962  hypothetical protein  37.76 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1123  hypothetical protein  47.92 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>