35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1211 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1211  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  390  1e-108  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.174889  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2610  hypothetical protein  52.17 
 
 
192 aa  191  8e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0338  hypothetical protein  41.27 
 
 
189 aa  161  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0278088  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0260  hypothetical protein  45.11 
 
 
197 aa  154  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0029368  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1924  hypothetical protein  48.6 
 
 
191 aa  153  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0360  hypothetical protein  43.48 
 
 
197 aa  153  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0611863  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0334  hypothetical protein  42.42 
 
 
208 aa  130  7.999999999999999e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.804201  normal  0.829767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1232  hypothetical protein  35.53 
 
 
164 aa  63.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0198  hypothetical protein  28 
 
 
144 aa  56.2  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000406548  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0396  endonuclease III  32.35 
 
 
174 aa  55.5  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1462  protein of unknown function DUF123  29.94 
 
 
142 aa  53.9  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02280  hypothetical protein  32.45 
 
 
138 aa  52.8  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273401  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0628  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.92 
 
 
357 aa  52.8  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0815  hypothetical protein  30.51 
 
 
127 aa  51.6  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1071  hypothetical protein  25.97 
 
 
356 aa  50.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.661198  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0898  protein of unknown function DUF123  28.99 
 
 
137 aa  50.1  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0253075  normal  0.780245 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0278  protein of unknown function DUF123  30.19 
 
 
125 aa  49.7  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0991873  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3380  protein of unknown function DUF123  30.92 
 
 
153 aa  49.7  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.798744  normal  0.147915 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0654  protein of unknown function DUF123  26.32 
 
 
136 aa  49.7  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1038  hypothetical protein  31.47 
 
 
146 aa  49.3  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.4343 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0858  hypothetical protein  28.74 
 
 
165 aa  48.5  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2695  hypothetical protein  30.07 
 
 
188 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1424  hypothetical protein  23.26 
 
 
138 aa  47  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.149794  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0356  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.1 
 
 
356 aa  47  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0334689  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1555  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  24.68 
 
 
356 aa  47  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.272014 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0507  hypothetical protein  30.67 
 
 
139 aa  47  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0319472  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1312  hypothetical protein  22.98 
 
 
162 aa  45.4  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.474029 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2572  hypothetical protein  32.17 
 
 
126 aa  45.4  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0625  hypothetical protein  25.64 
 
 
119 aa  45.4  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0479  protein of unknown function DUF123  28.48 
 
 
134 aa  45.4  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0578  protein of unknown function DUF123  26.32 
 
 
133 aa  44.7  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1807  hypothetical protein  27.59 
 
 
134 aa  44.7  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0796576  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3196  protein of unknown function DUF123  29.61 
 
 
141 aa  43.9  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0265  hypothetical protein  27.61 
 
 
143 aa  43.1  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0984626  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2461  hypothetical protein  28.57 
 
 
148 aa  42.4  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>