39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3180 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3180  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  337  5e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.942907  normal  0.672833 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1420  hypothetical protein  48.52 
 
 		 170 aa  171  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3561  hypothetical protein  51.95 
 
 		 185 aa  166  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248722  normal  0.0187655 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1180  hypothetical protein  45.22 
 
 		 161 aa  159  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1883  hypothetical protein  45.06 
 
 		 163 aa  157  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1531  hypothetical protein  45.57 
 
 		 163 aa  154  6e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.348224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1747  hypothetical protein  45.45 
 
 		 177 aa  151  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.497705  normal  0.12531 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7516  hypothetical protein  46.75 
 
 		 181 aa  145  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2771  hypothetical protein  43.33 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00380494 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1020  cell division protein ZipA  42.31 
 
 		 188 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.594259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1847  cell division protein ZipA  39.51 
 
 		 165 aa  116  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.630805  normal  0.844154 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0986  cell division protein ZipA  42.31 
 
 		 172 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3355  cell division protein ZipA  42.31 
 
 		 172 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1008  cell division protein ZipA  42.31 
 
 		 170 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3271  cell division protein ZipA  39.61 
 
 		 184 aa  106  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3212  cell division protein ZipA  36.02 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4505  hypothetical protein  50.54 
 
 		 93 aa  92  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4301  hypothetical protein  33.08 
 
 		 169 aa  64.3  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0177  hypothetical protein  30.19 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5693  hypothetical protein  48.28 
 
 		 112 aa  60.5  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201068  normal  0.494471 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06028  hypothetical protein  26.62 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4373  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.32 
 
 		 368 aa  50.8  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.742659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_902  hypothetical protein  28 
 
 		 200 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00277515  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1725  hypothetical protein  28.03 
 
 		 508 aa  48.9  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0914  kinase-like protein  26.4 
 
 		 200 aa  47.8  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0184467  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3317  aminoglycoside phosphotransferase  29.45 
 
 		 586 aa  45.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.479259  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1001  hypothetical protein  30.41 
 
 		 551 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0358581  hitchhiker  1.18173e-16 
 
 
-
 
NC_002936  DET1031  hypothetical protein  28 
 
 		 182 aa  45.1  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0138831  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5417  hypothetical protein  31.88 
 
 		 520 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62230  hypothetical protein  32.35 
 
 		 520 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.051332  normal  0.186531 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2628  hypothetical protein  27.74 
 
 		 517 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0861  hypothetical protein  30.88 
 
 		 532 aa  43.9  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00795594  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1458  hypothetical protein  31.45 
 
 		 509 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0841  hypothetical protein  29.77 
 
 		 556 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000255062  decreased coverage  0.0000936176 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3456  hypothetical protein  30.6 
 
 		 523 aa  41.6  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418547  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1206  hypothetical protein  27.33 
 
 		 513 aa  41.6  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.128112 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2379  hypothetical protein  27.61 
 
 		 509 aa  41.6  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0203614  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2165  aminoglycoside phosphotransferase  37.74 
 
 		 518 aa  40.8  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2783  hypothetical protein  30.6 
 
 		 523 aa  40.4  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.633184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>