42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2051 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2051  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  327  6e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2511  YHS domain protein  35.46 
 
 		 150 aa  112  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0278163 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2799  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  46.83 
 
 		 156 aa  103  7e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3004  YHS domain-containing protein  33.58 
 
 		 152 aa  100  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.392798  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0591  hypothetical protein  33.58 
 
 		 148 aa  97.1  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2766  hypothetical protein  39.45 
 
 		 150 aa  95.5  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.395057  hitchhiker  0.00432931 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3054  YHS domain-containing protein  34.15 
 
 		 149 aa  94.4  7e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.190417  hitchhiker  0.00884153 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2573  hypothetical protein  38.26 
 
 		 151 aa  93.6  9e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.243278  hitchhiker  0.000000387567 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1237  hypothetical protein  35.19 
 
 		 151 aa  92.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1237  hypothetical protein  35.19 
 
 		 151 aa  92.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3074  hypothetical protein  39.86 
 
 		 161 aa  92  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.479562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1024  hypothetical protein  34.81 
 
 		 181 aa  91.7  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.476818  normal  0.586442 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0413  hypothetical protein  34.88 
 
 		 141 aa  91.3  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.940702  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3840  hypothetical protein  30.71 
 
 		 163 aa  91.3  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000166878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1502  YHS domain-containing protein  32.64 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000768373 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0814  hypothetical protein  31.03 
 
 		 159 aa  89.7  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.226428  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3825  hypothetical protein  34.85 
 
 		 137 aa  88.6  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0281  YHS domain protein  40.37 
 
 		 163 aa  89  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1871  hypothetical protein  33.05 
 
 		 177 aa  89  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3681  hypothetical protein  30.72 
 
 		 168 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.137304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2489  hypothetical protein  39.5 
 
 		 174 aa  87  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0295  YHS domain-containing protein  34.43 
 
 		 150 aa  85.9  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0661  hypothetical protein  34.71 
 
 		 190 aa  85.5  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.313662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0344  YHS domain-containing protein  28.76 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0517  hypothetical protein  31.54 
 
 		 168 aa  82  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4250  hypothetical protein  32.67 
 
 		 168 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531589  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3923  hypothetical protein  32.47 
 
 		 168 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000190971  normal  0.484553 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2513  hypothetical protein  29.22 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0288069 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3397  hypothetical protein  30.63 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.492044  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3379  hypothetical protein  35.14 
 
 		 190 aa  78.2  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4039  hypothetical protein  37.61 
 
 		 194 aa  77.4  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.285921  normal  0.0353686 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3420  hypothetical protein  30.7 
 
 		 168 aa  77  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0574183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1901  YHS  30.15 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0342245  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6562  hypothetical protein  34.82 
 
 		 176 aa  75.5  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2517  YHS domain protein  32.46 
 
 		 181 aa  74.7  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal  0.0264071 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1814  hypothetical protein  30.82 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1729  YHS  27.59 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01845  hypothetical protein  29.06 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.207418  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1688  hypothetical protein  38.2 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0271736  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1716  hypothetical protein  28.7 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000302746 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4842  hypothetical protein  32.26 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.203705  normal  0.0407983 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2038  Thioredoxin domain protein  25.22 
 
 		 357 aa  42.4  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.571694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>