42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3379 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3379  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  380  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0517  hypothetical protein  76.79 
 
 		 168 aa  263  1e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1814  hypothetical protein  60.48 
 
 		 168 aa  198  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4250  hypothetical protein  57.14 
 
 		 168 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531589  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3681  hypothetical protein  55.95 
 
 		 168 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.137304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3923  hypothetical protein  50.6 
 
 		 168 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000190971  normal  0.484553 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6562  hypothetical protein  53.07 
 
 		 176 aa  170  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3004  YHS domain-containing protein  28.57 
 
 		 152 aa  86.7  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.392798  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4039  hypothetical protein  42.61 
 
 		 194 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.285921  normal  0.0353686 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1688  hypothetical protein  37.8 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0271736  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2489  hypothetical protein  30.49 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2051  hypothetical protein  35.14 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3420  hypothetical protein  33.09 
 
 		 168 aa  77  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0574183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4842  hypothetical protein  37.04 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.203705  normal  0.0407983 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3825  hypothetical protein  33.94 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3397  hypothetical protein  30.7 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.492044  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2799  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  36.15 
 
 		 156 aa  74.3  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0814  hypothetical protein  28.67 
 
 		 159 aa  74.3  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.226428  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1502  YHS domain-containing protein  28.91 
 
 		 147 aa  72  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000768373 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0591  hypothetical protein  27.27 
 
 		 148 aa  72  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3054  YHS domain-containing protein  32.43 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.190417  hitchhiker  0.00884153 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3074  hypothetical protein  31.62 
 
 		 161 aa  70.9  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.479562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2573  hypothetical protein  41.94 
 
 		 151 aa  70.9  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.243278  hitchhiker  0.000000387567 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1901  YHS  31.03 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0342245  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1716  hypothetical protein  33.64 
 
 		 211 aa  67  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000302746 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2511  YHS domain protein  31.58 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0278163 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2766  hypothetical protein  27.43 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.395057  hitchhiker  0.00432931 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0295  YHS domain-containing protein  30.58 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1871  hypothetical protein  29.51 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0281  YHS domain protein  34.59 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3840  hypothetical protein  32.48 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000166878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0661  hypothetical protein  32.2 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.313662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1729  YHS  23.38 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0413  hypothetical protein  29.41 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.940702  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2513  hypothetical protein  32.29 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0288069 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0344  YHS domain-containing protein  29.2 
 
 		 159 aa  52.8  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2517  YHS domain protein  25.41 
 
 		 181 aa  52  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal  0.0264071 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1237  hypothetical protein  22.41 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1237  hypothetical protein  22.41 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01845  hypothetical protein  25.2 
 
 		 150 aa  46.6  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.207418  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1024  hypothetical protein  23.57 
 
 		 181 aa  46.2  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.476818  normal  0.586442 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2038  Thioredoxin domain protein  27.2 
 
 		 357 aa  43.5  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.571694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>