41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1024 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1024  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  373  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.476818  normal  0.586442 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0661  hypothetical protein  41.67 
 
 
190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.313662  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3397  hypothetical protein  39.57 
 
 
161 aa  120  9e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.492044  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1237  hypothetical protein  44.44 
 
 
151 aa  120  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1237  hypothetical protein  44.44 
 
 
151 aa  120  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2573  hypothetical protein  48.65 
 
 
151 aa  118  4.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.243278  hitchhiker  0.000000387567 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0814  hypothetical protein  33.77 
 
 
159 aa  114  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.226428  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2511  YHS domain protein  41.38 
 
 
150 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0278163 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3074  hypothetical protein  37.33 
 
 
161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.479562  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2766  hypothetical protein  37.12 
 
 
150 aa  108  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.395057  hitchhiker  0.00432931 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0413  hypothetical protein  39.71 
 
 
141 aa  107  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.940702  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1502  YHS domain-containing protein  35.25 
 
 
147 aa  105  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000768373 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1901  YHS  37.41 
 
 
155 aa  105  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0342245  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3004  YHS domain-containing protein  35.29 
 
 
152 aa  102  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.392798  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1871  hypothetical protein  40.37 
 
 
177 aa  96.7  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0591  hypothetical protein  36.52 
 
 
148 aa  95.1  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3840  hypothetical protein  36.03 
 
 
163 aa  94.7  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000166878  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0344  YHS domain-containing protein  35.25 
 
 
159 aa  94.4  9e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2051  hypothetical protein  34.81 
 
 
160 aa  91.7  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3054  YHS domain-containing protein  35.4 
 
 
149 aa  90.1  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.190417  hitchhiker  0.00884153 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2489  hypothetical protein  34.48 
 
 
174 aa  83.6  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0295  YHS domain-containing protein  32.74 
 
 
150 aa  82  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01845  hypothetical protein  34.78 
 
 
150 aa  81.3  0.000000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.207418  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2799  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  35.53 
 
 
156 aa  76.3  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3420  hypothetical protein  29.09 
 
 
168 aa  75.9  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0574183  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2517  YHS domain protein  30.16 
 
 
181 aa  71.6  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal  0.0264071 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2513  hypothetical protein  29.66 
 
 
158 aa  71.2  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0288069 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0281  YHS domain protein  29.17 
 
 
163 aa  65.9  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1729  YHS  31.13 
 
 
177 aa  63.5  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3825  hypothetical protein  32.43 
 
 
137 aa  61.2  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6562  hypothetical protein  32.14 
 
 
176 aa  60.1  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1716  hypothetical protein  29.63 
 
 
211 aa  58.5  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000302746 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4039  hypothetical protein  32.11 
 
 
194 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.285921  normal  0.0353686 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3923  hypothetical protein  25.29 
 
 
168 aa  52  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000190971  normal  0.484553 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1688  hypothetical protein  37.04 
 
 
160 aa  51.2  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0271736  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4250  hypothetical protein  29.73 
 
 
168 aa  51.2  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531589  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0517  hypothetical protein  24.64 
 
 
168 aa  50.4  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3681  hypothetical protein  26.57 
 
 
168 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.137304  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4842  hypothetical protein  34.12 
 
 
159 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.203705  normal  0.0407983 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1814  hypothetical protein  26.13 
 
 
168 aa  47.8  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3379  hypothetical protein  23.57 
 
 
190 aa  46.2  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>