40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0507 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0507  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  212  9.999999999999999e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.220628 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0095  hypothetical protein  48.78 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0983  hypothetical protein  45.53 
 
 		 126 aa  99.4  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2643  hypothetical protein  45.53 
 
 		 126 aa  99.4  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.490629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0840  hypothetical protein  63.33 
 
 		 112 aa  85.5  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.235017 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2987  hypothetical protein  56.76 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0210  hypothetical protein  78.95 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0106  hypothetical protein  78.95 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.623317 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0063  hypothetical protein  63.27 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274759  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0166  hypothetical protein  76.32 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.424724  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0188  hypothetical protein  61.22 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6278  hypothetical protein  46.97 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.811266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0644  hypothetical protein  72.22 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.11055 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0401  hypothetical protein  73.53 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1113  hypothetical protein  64.71 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3610  hypothetical protein  69.7 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3675  hypothetical protein  48.21 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.287232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3455  hypothetical protein  39.74 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4032  hypothetical protein  67.65 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0024  hypothetical protein  72.73 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0394198  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0023  hypothetical protein  72.73 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.427633  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0191  hypothetical protein  68.75 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1302  hypothetical protein  69.7 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0136583  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4363  hypothetical protein  67.65 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0106891 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0032  hypothetical protein  70.97 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0296  hypothetical protein  48.08 
 
 		 109 aa  53.5  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.776414  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0616  hypothetical protein  51.35 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00777693 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2939  hypothetical protein  32.77 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.474871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7110  hypothetical protein  40 
 
 		 127 aa  47  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0100  hypothetical protein  39.22 
 
 		 156 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.131489 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0152  hypothetical protein  60.71 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5615  hypothetical protein  40.91 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0610106 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1327  hypothetical protein  34.41 
 
 		 105 aa  44.7  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0334928  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2914  hypothetical protein  43.18 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0809676 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6550  hypothetical protein  44.74 
 
 		 127 aa  43.5  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.746161  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2403  hypothetical protein  35.71 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.927771  normal  0.287495 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2126  hypothetical protein  35.71 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.158489 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2083  hypothetical protein  35.71 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.460533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0101  hypothetical protein  34.15 
 
 		 156 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.738872 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2459  hypothetical protein  72.73 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0545817  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>