27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0101 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0101  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  286  1e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.738872 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0100  hypothetical protein  45.45 
 
 
156 aa  84.3  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.131489 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0152  hypothetical protein  44.93 
 
 
158 aa  61.2  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5615  hypothetical protein  43.18 
 
 
128 aa  60.5  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0610106 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7110  hypothetical protein  35.86 
 
 
127 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2403  hypothetical protein  39.71 
 
 
125 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.927771  normal  0.287495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6550  hypothetical protein  67.57 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.746161  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2126  hypothetical protein  39.71 
 
 
125 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.158489 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2914  hypothetical protein  65.71 
 
 
108 aa  58.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0809676 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2083  hypothetical protein  66.67 
 
 
124 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.460533  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0032  hypothetical protein  50.82 
 
 
107 aa  57  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2939  hypothetical protein  58.33 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.474871  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0296  hypothetical protein  59.46 
 
 
109 aa  56.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.776414  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1327  hypothetical protein  46.94 
 
 
105 aa  53.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0334928  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3675  hypothetical protein  51.28 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.287232  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2459  hypothetical protein  48.98 
 
 
106 aa  48.9  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0545817  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0616  hypothetical protein  31.25 
 
 
118 aa  48.5  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00777693 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6278  hypothetical protein  56.67 
 
 
131 aa  47  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.811266  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0210  hypothetical protein  56.67 
 
 
137 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0106  hypothetical protein  56.67 
 
 
134 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.623317 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0166  hypothetical protein  56.67 
 
 
137 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.424724  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3610  hypothetical protein  52.78 
 
 
124 aa  45.1  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1492  hypothetical protein  40 
 
 
108 aa  43.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0401  hypothetical protein  53.33 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3455  hypothetical protein  56.25 
 
 
129 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0063  hypothetical protein  53.33 
 
 
133 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274759  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1113  hypothetical protein  34.62 
 
 
130 aa  41.2  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>