40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1113 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1113  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  248  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3610  hypothetical protein  58.59 
 
 
124 aa  94.7  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3455  hypothetical protein  56.48 
 
 
129 aa  93.2  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4032  hypothetical protein  60.27 
 
 
127 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7110  hypothetical protein  46.15 
 
 
127 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0188  hypothetical protein  45.86 
 
 
152 aa  83.6  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0106  hypothetical protein  44.78 
 
 
134 aa  83.2  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.623317 
 
 
-
 
NC_004310  BR0024  hypothetical protein  59.49 
 
 
127 aa  82.4  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0394198  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0023  hypothetical protein  59.49 
 
 
127 aa  82.4  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.427633  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1302  hypothetical protein  45.37 
 
 
125 aa  82  0.000000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0136583  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0166  hypothetical protein  44.93 
 
 
137 aa  80.1  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.424724  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0191  hypothetical protein  56.76 
 
 
128 aa  80.1  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0063  hypothetical protein  42.96 
 
 
133 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274759  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4363  hypothetical protein  57.53 
 
 
127 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0106891 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0032  hypothetical protein  55.7 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0210  hypothetical protein  44.2 
 
 
137 aa  77  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0616  hypothetical protein  48.06 
 
 
118 aa  73.2  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00777693 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0644  hypothetical protein  45.59 
 
 
152 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.11055 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2939  hypothetical protein  46.56 
 
 
121 aa  71.6  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.474871  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6278  hypothetical protein  46.84 
 
 
131 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.811266  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5615  hypothetical protein  42.96 
 
 
128 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0610106 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0401  hypothetical protein  79.41 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6550  hypothetical protein  42.96 
 
 
127 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.746161  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2126  hypothetical protein  41.54 
 
 
125 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.158489 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2403  hypothetical protein  41.54 
 
 
125 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.927771  normal  0.287495 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2643  hypothetical protein  73.53 
 
 
126 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.490629  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0983  hypothetical protein  73.53 
 
 
126 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0507  hypothetical protein  64.71 
 
 
109 aa  62.8  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220628 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0095  hypothetical protein  70.59 
 
 
126 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2987  hypothetical protein  58.82 
 
 
108 aa  58.2  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0840  hypothetical protein  61.76 
 
 
112 aa  56.6  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.235017 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2083  hypothetical protein  41.79 
 
 
124 aa  53.9  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.460533  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0152  hypothetical protein  61.11 
 
 
158 aa  50.8  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0100  hypothetical protein  35.29 
 
 
156 aa  50.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.131489 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2914  hypothetical protein  51.35 
 
 
108 aa  47.4  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0809676 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3675  hypothetical protein  41.18 
 
 
107 aa  46.2  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.287232  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0101  hypothetical protein  56.67 
 
 
156 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.738872 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0296  hypothetical protein  53.33 
 
 
109 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.776414  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1492  hypothetical protein  54.05 
 
 
108 aa  41.2  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2459  hypothetical protein  51.35 
 
 
106 aa  40.8  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0545817  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>