29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2459 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2459  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  206  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0545817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1327  hypothetical protein  64.56 
 
 		 105 aa  106  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0334928  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1492  hypothetical protein  68.97 
 
 		 108 aa  94.7  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2403  hypothetical protein  40.54 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.927771  normal  0.287495 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2126  hypothetical protein  40.54 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.158489 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2083  hypothetical protein  41.38 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.460533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0152  hypothetical protein  43.42 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7110  hypothetical protein  33.94 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6550  hypothetical protein  40.98 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.746161  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0296  hypothetical protein  53.19 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.776414  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0616  hypothetical protein  50 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00777693 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3675  hypothetical protein  44.07 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.287232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2939  hypothetical protein  34.95 
 
 		 121 aa  53.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.474871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0100  hypothetical protein  42.55 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.131489 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0101  hypothetical protein  48.98 
 
 		 156 aa  50.1  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.738872 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5615  hypothetical protein  42 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0610106 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0032  hypothetical protein  50 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2914  hypothetical protein  57.14 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0809676 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3610  hypothetical protein  48.65 
 
 		 124 aa  43.9  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0948  hypothetical protein  51.16 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.58558 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0953  hypothetical protein  43.75 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0951  hypothetical protein  43.75 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0507  hypothetical protein  50 
 
 		 109 aa  42  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.220628 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0095  hypothetical protein  58.62 
 
 		 126 aa  41.2  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6278  hypothetical protein  32.22 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.811266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0902  hypothetical protein  51.28 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0413569  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0983  hypothetical protein  66.67 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1113  hypothetical protein  51.35 
 
 		 130 aa  40.4  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2643  hypothetical protein  66.67 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.490629  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>