41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6278 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6278  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  251  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.811266  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5615  hypothetical protein  50.79 
 
 
128 aa  94.4  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0610106 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7110  hypothetical protein  48.78 
 
 
127 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0210  hypothetical protein  55 
 
 
137 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0063  hypothetical protein  57.83 
 
 
133 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274759  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0106  hypothetical protein  57.5 
 
 
134 aa  79.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.623317 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0188  hypothetical protein  82.05 
 
 
152 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0166  hypothetical protein  75.61 
 
 
137 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.424724  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2126  hypothetical protein  43.94 
 
 
125 aa  77  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.158489 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2403  hypothetical protein  43.94 
 
 
125 aa  77  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.927771  normal  0.287495 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0644  hypothetical protein  52.5 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.11055 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6550  hypothetical protein  48.75 
 
 
127 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.746161  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3610  hypothetical protein  42.27 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1113  hypothetical protein  48 
 
 
130 aa  71.2  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2083  hypothetical protein  43.94 
 
 
124 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.460533  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0401  hypothetical protein  79.41 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0507  hypothetical protein  68.42 
 
 
109 aa  67.8  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220628 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2643  hypothetical protein  39.77 
 
 
126 aa  67  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.490629  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0983  hypothetical protein  39.77 
 
 
126 aa  67  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0095  hypothetical protein  53.7 
 
 
126 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0840  hypothetical protein  46.15 
 
 
112 aa  65.5  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.235017 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2987  hypothetical protein  43.37 
 
 
108 aa  63.9  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3455  hypothetical protein  58.97 
 
 
129 aa  63.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1302  hypothetical protein  50 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0136583  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4032  hypothetical protein  53.85 
 
 
127 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0191  hypothetical protein  56.41 
 
 
128 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4363  hypothetical protein  53.85 
 
 
127 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0106891 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2939  hypothetical protein  30.88 
 
 
121 aa  55.1  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.474871  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0023  hypothetical protein  59.46 
 
 
127 aa  54.7  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.427633  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0024  hypothetical protein  59.46 
 
 
127 aa  54.7  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0394198  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0616  hypothetical protein  37.4 
 
 
118 aa  54.7  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00777693 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0032  hypothetical protein  40.79 
 
 
139 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0100  hypothetical protein  55.88 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.131489 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0152  hypothetical protein  63.33 
 
 
158 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2914  hypothetical protein  60.61 
 
 
108 aa  50.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0809676 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0101  hypothetical protein  56.67 
 
 
156 aa  47.8  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.738872 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0296  hypothetical protein  39.13 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.776414  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3675  hypothetical protein  33.85 
 
 
107 aa  43.9  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.287232  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0032  hypothetical protein  48.48 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2459  hypothetical protein  35.71 
 
 
106 aa  40.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0545817  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1327  hypothetical protein  25.47 
 
 
105 aa  40  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0334928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>