41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0296 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0296  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  211  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.776414  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2126  hypothetical protein  42.53 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.158489 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2403  hypothetical protein  42.53 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.927771  normal  0.287495 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2083  hypothetical protein  43.02 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.460533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2939  hypothetical protein  48.15 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.474871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0616  hypothetical protein  64.86 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00777693 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0152  hypothetical protein  41.25 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7110  hypothetical protein  42.24 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6550  hypothetical protein  53.33 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.746161  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2914  hypothetical protein  56.1 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0809676 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5615  hypothetical protein  56.76 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0610106 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0101  hypothetical protein  45.12 
 
 		 156 aa  57  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.738872 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0032  hypothetical protein  64.71 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1327  hypothetical protein  38.67 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0334928  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2459  hypothetical protein  53.19 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0545817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2643  hypothetical protein  36.9 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.490629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0095  hypothetical protein  38.57 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0507  hypothetical protein  53.85 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.220628 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0983  hypothetical protein  36.9 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0100  hypothetical protein  40 
 
 		 156 aa  51.6  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.131489 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3675  hypothetical protein  44.44 
 
 		 107 aa  50.4  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.287232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6278  hypothetical protein  35.23 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.811266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0106  hypothetical protein  47.73 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.623317 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0166  hypothetical protein  51.16 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.424724  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0951  hypothetical protein  38.27 
 
 		 88 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0953  hypothetical protein  38.27 
 
 		 88 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0063  hypothetical protein  44.68 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274759  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0840  hypothetical protein  48.72 
 
 		 112 aa  46.2  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.235017 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0210  hypothetical protein  48.84 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2987  hypothetical protein  56.67 
 
 		 108 aa  46.2  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3610  hypothetical protein  60 
 
 		 124 aa  45.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0188  hypothetical protein  40 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0401  hypothetical protein  53.33 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1492  hypothetical protein  38.71 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0644  hypothetical protein  45.24 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.11055 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3455  hypothetical protein  53.12 
 
 		 129 aa  41.6  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1113  hypothetical protein  53.33 
 
 		 130 aa  41.2  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4032  hypothetical protein  53.12 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0191  hypothetical protein  53.33 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0948  hypothetical protein  41.07 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.58558 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4363  hypothetical protein  53.12 
 
 		 127 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0106891 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>