44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5615 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5615  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  249  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0610106 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7110  hypothetical protein  66.41 
 
 
127 aa  154  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2126  hypothetical protein  68.94 
 
 
125 aa  141  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.158489 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2403  hypothetical protein  68.94 
 
 
125 aa  141  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.927771  normal  0.287495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6550  hypothetical protein  65.89 
 
 
127 aa  136  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.746161  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2083  hypothetical protein  66.92 
 
 
124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.460533  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2939  hypothetical protein  46.46 
 
 
121 aa  95.9  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.474871  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0616  hypothetical protein  47.33 
 
 
118 aa  84.3  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00777693 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6278  hypothetical protein  53.49 
 
 
131 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.811266  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0100  hypothetical protein  43.3 
 
 
156 aa  60.5  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.131489 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2914  hypothetical protein  45.9 
 
 
108 aa  58.9  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0809676 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0210  hypothetical protein  36.5 
 
 
137 aa  57.4  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0032  hypothetical protein  69.7 
 
 
107 aa  57  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0152  hypothetical protein  63.89 
 
 
158 aa  57  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0101  hypothetical protein  41.76 
 
 
156 aa  57  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.738872 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3610  hypothetical protein  44.19 
 
 
124 aa  55.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0296  hypothetical protein  56.76 
 
 
109 aa  55.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.776414  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0106  hypothetical protein  37.5 
 
 
134 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.623317 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1113  hypothetical protein  41.61 
 
 
130 aa  55.5  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0166  hypothetical protein  37.23 
 
 
137 aa  52.8  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.424724  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3455  hypothetical protein  40.74 
 
 
129 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0188  hypothetical protein  34.78 
 
 
152 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2459  hypothetical protein  42 
 
 
106 aa  47.4  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0545817  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0644  hypothetical protein  31.34 
 
 
152 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.11055 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3675  hypothetical protein  47.37 
 
 
107 aa  47  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.287232  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0095  hypothetical protein  38.33 
 
 
126 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0063  hypothetical protein  36.76 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274759  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0983  hypothetical protein  37.29 
 
 
126 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0953  hypothetical protein  52.94 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2643  hypothetical protein  37.29 
 
 
126 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.490629  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4032  hypothetical protein  55.56 
 
 
127 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0951  hypothetical protein  52.94 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4363  hypothetical protein  55.56 
 
 
127 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0106891 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0902  hypothetical protein  58.62 
 
 
88 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0413569  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1302  hypothetical protein  55.56 
 
 
125 aa  43.5  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0136583  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0401  hypothetical protein  48.48 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0507  hypothetical protein  40.91 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220628 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1327  hypothetical protein  38 
 
 
105 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0334928  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0948  hypothetical protein  58.62 
 
 
90 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.58558 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0023  hypothetical protein  52.78 
 
 
127 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.427633  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0024  hypothetical protein  52.78 
 
 
127 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0394198  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2987  hypothetical protein  34.62 
 
 
108 aa  40.8  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0191  hypothetical protein  60 
 
 
128 aa  40.8  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1492  hypothetical protein  38 
 
 
108 aa  40.4  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.223767 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>