35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0840 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0840  hypothetical protein  100 
 
 
112 aa  211  3.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.235017 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2987  hypothetical protein  60.26 
 
 
108 aa  95.9  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0095  hypothetical protein  54.7 
 
 
126 aa  90.5  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0983  hypothetical protein  51.28 
 
 
126 aa  90.1  9e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2643  hypothetical protein  51.28 
 
 
126 aa  90.1  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.490629  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0507  hypothetical protein  63.33 
 
 
109 aa  82.4  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220628 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6278  hypothetical protein  43.75 
 
 
131 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.811266  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0166  hypothetical protein  69.44 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.424724  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0210  hypothetical protein  69.44 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0106  hypothetical protein  65.79 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.623317 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3675  hypothetical protein  47.37 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.287232  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0063  hypothetical protein  66.67 
 
 
133 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274759  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0188  hypothetical protein  67.65 
 
 
152 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0401  hypothetical protein  64.71 
 
 
140 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0644  hypothetical protein  64.71 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.11055 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3610  hypothetical protein  41.38 
 
 
124 aa  58.9  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1113  hypothetical protein  61.76 
 
 
130 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1302  hypothetical protein  55.1 
 
 
125 aa  52  0.000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0136583  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3455  hypothetical protein  61.76 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4032  hypothetical protein  64.71 
 
 
127 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4363  hypothetical protein  60.53 
 
 
127 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0106891 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0023  hypothetical protein  63.64 
 
 
127 aa  49.3  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.427633  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0191  hypothetical protein  62.5 
 
 
128 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0024  hypothetical protein  63.64 
 
 
127 aa  49.3  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0394198  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0032  hypothetical protein  67.74 
 
 
139 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0296  hypothetical protein  50 
 
 
109 aa  46.2  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.776414  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0152  hypothetical protein  33.7 
 
 
158 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2939  hypothetical protein  34 
 
 
121 aa  45.1  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.474871  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0100  hypothetical protein  36.36 
 
 
156 aa  44.3  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.131489 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5615  hypothetical protein  31.25 
 
 
128 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0610106 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0616  hypothetical protein  50 
 
 
118 aa  43.9  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00777693 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1327  hypothetical protein  64 
 
 
105 aa  41.2  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0334928  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2126  hypothetical protein  36.84 
 
 
125 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.158489 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2403  hypothetical protein  36.84 
 
 
125 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.927771  normal  0.287495 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2914  hypothetical protein  45.45 
 
 
108 aa  40.4  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0809676 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>