38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0188 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0188  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  299  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0644  hypothetical protein  96.71 
 
 		 152 aa  197  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.11055 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0106  hypothetical protein  75.56 
 
 		 134 aa  166  9e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.623317 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0166  hypothetical protein  75.18 
 
 		 137 aa  163  6.9999999999999995e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.424724  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0063  hypothetical protein  80 
 
 		 133 aa  158  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274759  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0210  hypothetical protein  72.66 
 
 		 137 aa  152  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0401  hypothetical protein  77.14 
 
 		 140 aa  137  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6278  hypothetical protein  58.33 
 
 		 131 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.811266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1113  hypothetical protein  54.88 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0507  hypothetical protein  56.9 
 
 		 109 aa  73.6  0.0000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.220628 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7110  hypothetical protein  37.04 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0616  hypothetical protein  43.28 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00777693 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3610  hypothetical protein  45.98 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0095  hypothetical protein  65.96 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0983  hypothetical protein  65.22 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2643  hypothetical protein  65.22 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.490629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0032  hypothetical protein  48.84 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5615  hypothetical protein  37.24 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0610106 
 
 
-
 
NC_004310  BR0024  hypothetical protein  52.44 
 
 		 127 aa  67  0.00000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0394198  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0023  hypothetical protein  52.44 
 
 		 127 aa  67  0.00000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.427633  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2987  hypothetical protein  45.45 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2939  hypothetical protein  37.31 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.474871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4032  hypothetical protein  47.3 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3455  hypothetical protein  43.75 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0840  hypothetical protein  63.89 
 
 		 112 aa  62  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.235017 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4363  hypothetical protein  61.54 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0106891 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0191  hypothetical protein  61.54 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2126  hypothetical protein  35.25 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.158489 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2403  hypothetical protein  35.25 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.927771  normal  0.287495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6550  hypothetical protein  34.56 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.746161  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1302  hypothetical protein  43.9 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0136583  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2083  hypothetical protein  34.07 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.460533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0152  hypothetical protein  52.94 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2914  hypothetical protein  54.55 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0809676 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0100  hypothetical protein  50 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.131489 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0296  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  44.7  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.776414  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3675  hypothetical protein  34.78 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.287232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0101  hypothetical protein  50 
 
 		 156 aa  40.4  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.738872 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>