37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2987 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2987  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  206  6e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0840  hypothetical protein  60.71 
 
 		 112 aa  98.2  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.235017 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0983  hypothetical protein  50 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2643  hypothetical protein  50 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.490629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0095  hypothetical protein  46.61 
 
 		 126 aa  88.2  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0507  hypothetical protein  69.57 
 
 		 109 aa  78.6  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.220628 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6278  hypothetical protein  43.37 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.811266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0166  hypothetical protein  71.05 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.424724  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0401  hypothetical protein  76.47 
 
 		 140 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0063  hypothetical protein  71.05 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274759  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0210  hypothetical protein  68.42 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0106  hypothetical protein  68.42 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.623317 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0188  hypothetical protein  72.22 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0644  hypothetical protein  72.22 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.11055 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3675  hypothetical protein  45.59 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.287232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3610  hypothetical protein  66.67 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1113  hypothetical protein  36.71 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4032  hypothetical protein  40.51 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3455  hypothetical protein  48.94 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1302  hypothetical protein  63.64 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0136583  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0023  hypothetical protein  69.7 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.427633  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0024  hypothetical protein  69.7 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0394198  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4363  hypothetical protein  51.11 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0106891 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0152  hypothetical protein  37.04 
 
 		 158 aa  51.6  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2939  hypothetical protein  32.29 
 
 		 121 aa  50.4  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.474871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0032  hypothetical protein  67.74 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0191  hypothetical protein  44.68 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0296  hypothetical protein  51.28 
 
 		 109 aa  46.2  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.776414  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0100  hypothetical protein  33.33 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.131489 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2126  hypothetical protein  33.64 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.158489 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2403  hypothetical protein  33.64 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.927771  normal  0.287495 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2083  hypothetical protein  31.11 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.460533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7110  hypothetical protein  32.73 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5615  hypothetical protein  32.18 
 
 		 128 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0610106 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0616  hypothetical protein  48.48 
 
 		 118 aa  44.3  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00777693 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2914  hypothetical protein  45.71 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0809676 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6550  hypothetical protein  31.65 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.746161  normal  0.420331 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>