19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2750 on replicon NC_013930
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013930  TK90_2750  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  303  4.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.606258 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4247  hypothetical protein  34.58 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2215  hypothetical protein  31.39 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2777  hypothetical protein  38.1 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1602  hypothetical protein  30.3 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3712  hypothetical protein  43.75 
 
 		 603 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000102893  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2740  hypothetical protein  53.33 
 
 		 610 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0048024  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1501  hypothetical protein  51.11 
 
 		 608 aa  47.4  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.96972 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1816  Ig family protein  35 
 
 		 1626 aa  47.4  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2391  fibronectin, type III domain-containing protein  37.1 
 
 		 631 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00263498  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.83 
 
 		 648 aa  46.2  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5582  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  36 
 
 		 193 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2387  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.3 
 
 		 680 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.900198  decreased coverage  0.000000289366 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1552  Ig family protein  42.22 
 
 		 1544 aa  45.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1034  hypothetical protein  51.11 
 
 		 1104 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.881671 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1129  hypothetical protein  29.63 
 
 		 454 aa  42.4  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.32866 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0334  hypothetical protein  28.75 
 
 		 343 aa  41.2  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2528  hypothetical protein  31.07 
 
 		 321 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000345829  normal  0.074793 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1798  hypothetical protein  46.67 
 
 		 1145 aa  40  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.314403 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>