26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2549 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_2549  HPr kinase  100 
 
 
303 aa  619  1e-176  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0304295 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1540  HPr kinase  54.33 
 
 
304 aa  323  3e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2497  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  51.32 
 
 
309 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0708  HPr kinase  43.89 
 
 
305 aa  267  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0102  HPr kinase  43.84 
 
 
301 aa  248  6e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.263394  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3100  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  46.26 
 
 
293 aa  242  7e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325175  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1211  HPr kinase  40.75 
 
 
303 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0594  HPr kinase  39.74 
 
 
307 aa  212  7e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.276169 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2445  HPr kinase  37.76 
 
 
313 aa  196  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00295018  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1428  hypothetical protein  38.83 
 
 
285 aa  169  4e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01318  HPr kinase  40.72 
 
 
203 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.362805  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3572  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  35.89 
 
 
288 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1373  HPr kinase  34.59 
 
 
330 aa  132  6e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.401214  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2816  HPr kinase  30.19 
 
 
292 aa  67  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4105  hypothetical protein  27.84 
 
 
404 aa  62.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26991  hypothetical protein  57.45 
 
 
302 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0215  HPr kinase  28.51 
 
 
366 aa  53.9  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.623305 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1464  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  54.35 
 
 
300 aa  49.7  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3012  HPr kinase  26.02 
 
 
398 aa  49.7  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1280  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  47.54 
 
 
323 aa  48.9  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1585  HPr kinase  30.2 
 
 
326 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0056  HPr kinase  41.51 
 
 
301 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16420  hypothetical protein  40.24 
 
 
428 aa  44.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.20309  normal  0.209214 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0872  HPr kinase  34.78 
 
 
347 aa  43.5  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3385  HPr kinase  34.33 
 
 
324 aa  43.5  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.448245  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2661  hypothetical protein  36.92 
 
 
296 aa  43.5  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0700919  decreased coverage  0.00119506 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>