185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0728 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0728  FAD-binding protein, putative  100 
 
 
281 aa  573  1.0000000000000001e-163  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.254128  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1444  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  29.51 
 
 
280 aa  90.9  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2010  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  26.43 
 
 
284 aa  82  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1819  medium FAD-binding subunit of molybdenum enzyme  26.98 
 
 
280 aa  74.3  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0566  hypothetical protein  28.72 
 
 
289 aa  73.6  0.000000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1137  dehydrogenase  29.44 
 
 
282 aa  73.2  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.351482  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3791  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  29.46 
 
 
275 aa  68.9  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.292044  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1733  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  29.48 
 
 
292 aa  68.2  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2413  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  24.26 
 
 
276 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0448  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  25 
 
 
282 aa  67  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.221209  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2646  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  33.09 
 
 
283 aa  67  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2861  xanthine dehydrogenase, small subunit  25.24 
 
 
488 aa  66.6  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0406506  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3133  xanthine dehydrogenase, small subunit  26.35 
 
 
488 aa  65.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207802  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1590  xanthine dehydrogenase, small subunit  26.67 
 
 
484 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.597851 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4278  xanthine dehydrogenase, XdhA subunit  26.21 
 
 
484 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.513605  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3604  xanthine dehydrogenase, small subunit  26.22 
 
 
484 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.703198  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3842  xanthine dehydrogenase, small subunit  26.91 
 
 
484 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.977655  normal  0.775119 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2836  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding protein  27.97 
 
 
289 aa  62.4  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0853655  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2833  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  26.89 
 
 
492 aa  62.4  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3000  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  29.45 
 
 
292 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1453  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  22.01 
 
 
461 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4157  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  29.45 
 
 
292 aa  62  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.533292 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3192  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  29.45 
 
 
292 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02700  xanthine dehydrogenase, FAD-binding subunit  29.45 
 
 
292 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0825  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  29.45 
 
 
292 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4286  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  26.58 
 
 
283 aa  61.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02662  hypothetical protein  29.45 
 
 
292 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0841  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  29.45 
 
 
292 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5969  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  27.98 
 
 
275 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.862592  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2224  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  26.8 
 
 
289 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.844941  hitchhiker  0.000850669 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3948  hypothetical protein  30.26 
 
 
485 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.804932  normal  0.121566 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0451  xanthine dehydrogenase small subunit  28.57 
 
 
496 aa  61.2  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608502  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3027  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  29.45 
 
 
292 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2097  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  26.19 
 
 
284 aa  60.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185965  normal  0.611638 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3237  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  26.77 
 
 
485 aa  59.7  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.492862  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0259  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  22.91 
 
 
514 aa  59.7  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0767  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  31.98 
 
 
281 aa  58.5  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00225703 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2772  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  24.74 
 
 
283 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137285  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2837  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  30 
 
 
288 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3554  xanthine dehydrogenase, small subunit  24.56 
 
 
485 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2704  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  30.25 
 
 
487 aa  57.4  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.299034 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0193  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  21.79 
 
 
273 aa  57  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2958  putative xanthine dehydrogenase  27.73 
 
 
483 aa  57.4  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0528227 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3320  xanthine dehydrogenase  26.92 
 
 
490 aa  56.6  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.151633  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0238  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  23.66 
 
 
278 aa  56.6  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02515  putative xanthine dehydrogenase, XdhA subunit  24.71 
 
 
480 aa  56.2  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2603  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  31.93 
 
 
468 aa  56.6  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6765  (2Fe-2S)-binding domain protein  26.2 
 
 
470 aa  56.2  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1210  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  29.03 
 
 
284 aa  55.8  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0358548  normal  0.452165 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2144  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  25.26 
 
 
288 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0793  xanthine dehydrogenase, small subunit  22.86 
 
 
507 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.229921 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2153  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  29.91 
 
 
292 aa  55.5  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.891805 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4115  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  25.7 
 
 
290 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1815  ferredoxin:molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:[2Fe-2S]-binding:CO dehydrogenase flavoprotein, C-terminal  24.29 
 
 
484 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.522719  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3872  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  22.87 
 
 
285 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4257  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  27.73 
 
 
481 aa  55.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1636  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  25.41 
 
 
490 aa  55.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5284  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  25.14 
 
 
290 aa  54.7  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2066  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  35.45 
 
 
1062 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0951038  normal  0.0311361 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2424  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  30.33 
 
 
480 aa  54.7  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2699  xanthine dehydrogenase small subunit  24.74 
 
 
499 aa  54.3  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2539  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  25.16 
 
 
287 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0444448  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3759  xanthine dehydrogenase small subunit  28.95 
 
 
467 aa  54.7  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4104  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  26.42 
 
 
289 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2774  xanthine dehydrogenase, FAD-binding protein, putative  27.48 
 
 
291 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5443  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  25.45 
 
 
267 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465683  normal  0.297557 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3208  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  29.77 
 
 
291 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.426898  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1738  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  31.91 
 
 
305 aa  53.5  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2134  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:CO dehydrogenase flavoprotein-like  25.35 
 
 
289 aa  53.5  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2881  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  24.32 
 
 
265 aa  53.5  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5517  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  28.71 
 
 
284 aa  52.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480424  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1334  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  24.59 
 
 
295 aa  52.8  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332436 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0711  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  23.74 
 
 
520 aa  52.8  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3389  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  25.9 
 
 
286 aa  52.8  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0609  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  23.38 
 
 
278 aa  52.4  0.000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.515011  normal  0.94537 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4620  xanthine dehydrogenase small subunit  26.32 
 
 
493 aa  52.4  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.546493 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1747  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  27.01 
 
 
287 aa  52.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.795465  normal  0.613894 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1797  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  23.74 
 
 
484 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.014868  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2949  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  25.9 
 
 
273 aa  52.4  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000190078 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0777  xanthine dehydrogenase, FAD-binding protein, putative  29.45 
 
 
288 aa  52  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0643  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  27.34 
 
 
287 aa  52  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2422  xanthine dehydrogenase, small subunit  28 
 
 
505 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0920  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  29.45 
 
 
288 aa  52  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.815419  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2751  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  27.01 
 
 
479 aa  52  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0433722  normal  0.51663 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0226  xanthine dehydrogenase, small subunit  25.17 
 
 
497 aa  51.6  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.183423  normal  0.106399 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4736  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  29.41 
 
 
296 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1054  putative oxidoreductase  25.79 
 
 
278 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0416328  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0530  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  26.77 
 
 
289 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5750  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  26.73 
 
 
284 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.436516  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4923  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  24.38 
 
 
285 aa  50.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.514646  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0728  xanthine dehydrogenase, small subunit  23.02 
 
 
527 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.461227 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3160  xanthine dehydrogenase, small subunit  22.29 
 
 
505 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3199  xanthine dehydrogenase family protein, iron-sulfur-binding/FAD-binding subunit  21.69 
 
 
505 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188115  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0498  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  30.71 
 
 
262 aa  51.2  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.866988  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0349  xanthine dehydrogenase, putative  26.05 
 
 
492 aa  50.4  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2042  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  21.69 
 
 
505 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3215  xanthine dehydrogenase  21.69 
 
 
505 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.413066  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0871  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  21.69 
 
 
505 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.222869  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2705  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  21.69 
 
 
505 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1905  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  21.69 
 
 
505 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.259352  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>