More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0776 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0776  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  100 
 
 
441 aa  914    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4763  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  37.88 
 
 
429 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0198296  hitchhiker  0.00000268421 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4395  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  36.72 
 
 
428 aa  306  5.0000000000000004e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.477059 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0603  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  37.81 
 
 
430 aa  305  1.0000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00173495  normal  0.408623 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0260  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  37.12 
 
 
428 aa  304  2.0000000000000002e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000673067  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4722  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  38.55 
 
 
423 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00359952 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1974  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  37.44 
 
 
434 aa  301  2e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0473  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  36.72 
 
 
429 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3085  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  36.57 
 
 
425 aa  300  3e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132958  hitchhiker  0.00329333 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2743  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  36.95 
 
 
426 aa  297  2e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.551592  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2020  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  36.32 
 
 
429 aa  296  4e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4103  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  35.71 
 
 
429 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4064  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  35.71 
 
 
429 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4620  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  36.09 
 
 
429 aa  293  3e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.445071  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3366  nucleotidyl transferase  36.1 
 
 
429 aa  290  5.0000000000000004e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.179671  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1981  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  36.89 
 
 
439 aa  288  1e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.110638  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08071  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  36.18 
 
 
431 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  decreased coverage  0.00949474  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0175  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  36.18 
 
 
431 aa  288  2e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.99334  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08291  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  36.41 
 
 
431 aa  286  5e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.231953  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1255  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  36.18 
 
 
431 aa  286  5e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.13424  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0777  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  36.64 
 
 
431 aa  286  7e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08311  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  36.18 
 
 
431 aa  285  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09931  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  35.48 
 
 
431 aa  282  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.545811 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16851  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  36.41 
 
 
431 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08141  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  35.94 
 
 
431 aa  280  3e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.6433  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2035  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  36.32 
 
 
424 aa  278  2e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35780  predicted protein  34.56 
 
 
433 aa  269  8.999999999999999e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.653202 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42209  predicted protein  33.33 
 
 
475 aa  264  2e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000356266  hitchhiker  0.000000600938 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1227  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  34.33 
 
 
431 aa  264  2e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0241  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  34.62 
 
 
412 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.558186  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0708  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  34.77 
 
 
423 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.810772  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0684  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  34.77 
 
 
423 aa  213  7e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0349  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  31.74 
 
 
413 aa  213  7e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0946  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  31.69 
 
 
416 aa  208  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.807387  normal  0.432603 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003947  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.39 
 
 
405 aa  208  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.870453  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0118  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  29.66 
 
 
413 aa  207  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0107  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  29.2 
 
 
413 aa  206  8e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0806  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.86 
 
 
413 aa  206  9e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.462014  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01575  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  29.93 
 
 
405 aa  206  9e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3355  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  32.25 
 
 
413 aa  204  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.548111 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0100  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  29.75 
 
 
413 aa  202  7e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0900911  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1529  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.8 
 
 
421 aa  202  8e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116874 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0906  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  32.02 
 
 
413 aa  202  9e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.826098  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0238  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  31.02 
 
 
418 aa  202  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2061  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.75 
 
 
439 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1330  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.63 
 
 
405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0374066  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3034  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.63 
 
 
407 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0101  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  28.73 
 
 
411 aa  201  3e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.495793  normal  0.0768686 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1505  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  33.25 
 
 
415 aa  200  3.9999999999999996e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3797  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.65 
 
 
417 aa  199  6e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0418315 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3699  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  31.29 
 
 
417 aa  199  7e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00250611  normal  0.0813218 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0782  Nucleotidyl transferase  33.02 
 
 
417 aa  199  7.999999999999999e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1543  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.95 
 
 
413 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00354872  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0655  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  31.05 
 
 
423 aa  198  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.188651  normal  0.102422 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1368  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  31.36 
 
 
427 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.782994  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4716  nucleotidyl transferase  33.16 
 
 
407 aa  197  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950002  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2144  Nucleotidyl transferase  31.37 
 
 
418 aa  196  5.000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0642356  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1433  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  31.08 
 
 
421 aa  196  7e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2073  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.65 
 
 
421 aa  196  9e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0861  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  31.19 
 
 
413 aa  195  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.506105  normal  0.404079 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0086  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  32.06 
 
 
388 aa  195  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3166  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.8 
 
 
426 aa  194  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3798  Nucleotidyl transferase  31.29 
 
 
413 aa  194  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.136621 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06920  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  32.32 
 
 
390 aa  193  4e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0299  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  31.18 
 
 
424 aa  193  4e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0990  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.84 
 
 
425 aa  193  5e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.588268 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3698  nucleotidyl transferase  28.47 
 
 
415 aa  193  6e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.526056  normal  0.0360642 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4717  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.64 
 
 
415 aa  193  7e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.127421  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0909  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  32.05 
 
 
418 aa  192  7e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.751771  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0508  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  31.39 
 
 
422 aa  192  9e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2932  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  31.58 
 
 
420 aa  192  9e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00275218  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0637  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.21 
 
 
407 aa  192  9e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0718  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.68 
 
 
425 aa  192  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.917503  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0561  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.98 
 
 
389 aa  192  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1242  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  31.4 
 
 
417 aa  191  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05944  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  31.07 
 
 
404 aa  191  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3894  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  31.09 
 
 
431 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03282  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.59 
 
 
438 aa  190  4e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000760343  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0284  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.59 
 
 
431 aa  190  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000350445  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4742  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.59 
 
 
431 aa  190  4e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03235  hypothetical protein  30.59 
 
 
431 aa  190  4e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000332683  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0282  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.59 
 
 
431 aa  190  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000242921  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3909  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.59 
 
 
431 aa  190  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3712  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.59 
 
 
431 aa  190  4e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.499827  normal  0.460208 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3630  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.59 
 
 
431 aa  190  4e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0063  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  28.97 
 
 
403 aa  189  7e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122298 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0947  nucleotidyl transferase  29.25 
 
 
415 aa  189  8e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3935  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.35 
 
 
425 aa  188  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17060  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.59 
 
 
399 aa  189  1e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0776  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.15 
 
 
423 aa  189  1e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1049  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  31.3 
 
 
382 aa  188  2e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5800  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  29.66 
 
 
423 aa  188  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1797  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.25 
 
 
422 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.477582  normal  0.903839 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0225  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.85 
 
 
428 aa  187  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.832621  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0905  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.88 
 
 
423 aa  187  3e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.693448  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2768  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.39 
 
 
412 aa  187  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0868  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.77 
 
 
377 aa  187  3e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00134562  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1864  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  28.25 
 
 
423 aa  187  3e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1543  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.75 
 
 
420 aa  187  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2113  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  31.63 
 
 
408 aa  186  5e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.696559  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>