More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0946 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0946  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  100 
 
 		 416 aa  857    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.807387  normal  0.432603 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3797  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  81.53 
 
 		 417 aa  702    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0418315 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3699  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  97.36 
 
 		 417 aa  817    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00250611  normal  0.0813218 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4717  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  76.2 
 
 		 415 aa  666    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.127421  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0782  Nucleotidyl transferase  50.95 
 
 		 417 aa  435  1e-121  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2144  Nucleotidyl transferase  52.14 
 
 		 418 aa  436  1e-121  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0642356  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3698  nucleotidyl transferase  50.12 
 
 		 415 aa  423  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.526056  normal  0.0360642 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0947  nucleotidyl transferase  53.28 
 
 		 415 aa  423  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3798  Nucleotidyl transferase  50.6 
 
 		 413 aa  424  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.136621 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0708  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  50.36 
 
 		 423 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.810772  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0684  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  49.16 
 
 		 423 aa  412  1e-114  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1505  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  49.12 
 
 		 415 aa  408  1e-113  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3401  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  47 
 
 		 426 aa  410  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0552961  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3166  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  47.37 
 
 		 426 aa  410  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0241  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  49.16 
 
 		 412 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.558186  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4716  nucleotidyl transferase  49.28 
 
 		 407 aa  402  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950002  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0909  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  46.56 
 
 		 418 aa  395  1e-109  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.751771  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0086  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  50.41 
 
 		 388 aa  381  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1455  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  45.41 
 
 		 399 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0819  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  46.82 
 
 		 402 aa  363  2e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.24156 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06920  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  45.71 
 
 		 390 aa  362  8e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0557  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  46.17 
 
 		 393 aa  360  3e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.920393  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0724  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  47.54 
 
 		 380 aa  355  1e-96  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17060  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  47.44 
 
 		 399 aa  351  1e-95  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0854  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  48.73 
 
 		 379 aa  350  2e-95  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0620001  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1049  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  46.67 
 
 		 382 aa  345  1e-93  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4760  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  49.86 
 
 		 376 aa  343  2e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4598  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  49.86 
 
 		 376 aa  343  2e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4620  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  49.86 
 
 		 376 aa  343  2e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5122  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  49.86 
 
 		 376 aa  343  2e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4709  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  50.14 
 
 		 376 aa  344  2e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0559  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  50.6 
 
 		 360 aa  343  5e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5027  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  49.58 
 
 		 376 aa  342  7e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4979  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  49.86 
 
 		 367 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0868  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  45.43 
 
 		 377 aa  339  5.9999999999999996e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00134562  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4998  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  49.57 
 
 		 367 aa  339  7e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0239  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  49.57 
 
 		 367 aa  338  9e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.440264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5008  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  49.57 
 
 		 367 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0561  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  46.29 
 
 		 389 aa  332  7.000000000000001e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3503  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  48.72 
 
 		 376 aa  332  1e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3198  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  42.96 
 
 		 398 aa  328  7e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1529  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  45.65 
 
 		 421 aa  319  7e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116874 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0585  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  46.57 
 
 		 440 aa  316  5e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.920968 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0718  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  44.22 
 
 		 425 aa  313  4.999999999999999e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.917503  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0508  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  44.85 
 
 		 422 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0905  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  43.58 
 
 		 423 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.693448  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2073  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  46.01 
 
 		 421 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1106  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  44.12 
 
 		 421 aa  306  6e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.495993  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0637  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  42.82 
 
 		 407 aa  301  1e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03282  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  43.16 
 
 		 438 aa  300  3e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000760343  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0959  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  43.58 
 
 		 422 aa  300  3e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256851 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0284  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  43.16 
 
 		 431 aa  300  4e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000350445  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3712  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  43.16 
 
 		 431 aa  300  4e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.499827  normal  0.460208 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4742  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  43.16 
 
 		 431 aa  300  4e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3894  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  43.16 
 
 		 431 aa  300  4e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0282  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  43.16 
 
 		 431 aa  300  4e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000242921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3630  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  43.16 
 
 		 431 aa  300  4e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03235  hypothetical protein  43.16 
 
 		 431 aa  300  4e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000332683  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3909  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  43.16 
 
 		 431 aa  300  4e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3845  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  42.41 
 
 		 431 aa  299  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.725074 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3726  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  42.41 
 
 		 431 aa  299  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3803  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  42.41 
 
 		 431 aa  299  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1474  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  44.3 
 
 		 424 aa  299  6e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3737  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  42.41 
 
 		 431 aa  299  7e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2061  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  43.62 
 
 		 439 aa  297  2e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1433  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  43.09 
 
 		 421 aa  297  2e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3906  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  42.15 
 
 		 431 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.732676  normal  0.475217 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1691  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  43.07 
 
 		 416 aa  296  5e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.620576  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1106  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  42.54 
 
 		 422 aa  296  5e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0776  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  44.27 
 
 		 423 aa  296  6e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3167  glucose-1-phosphate adenylyltransferase, GlgD subunit  41.57 
 
 		 373 aa  295  8e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2838  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  42.33 
 
 		 435 aa  295  1e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1242  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  41.28 
 
 		 417 aa  295  1e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1368  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  43.12 
 
 		 427 aa  294  2e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.782994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3838  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  42.63 
 
 		 431 aa  294  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05944  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  42.97 
 
 		 404 aa  293  3e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2459  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  42.08 
 
 		 435 aa  292  7e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000209  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  41.76 
 
 		 405 aa  292  9e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02421  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  44.5 
 
 		 431 aa  291  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.962806  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4134  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  41.58 
 
 		 425 aa  290  4e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.527563  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1330  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  38.37 
 
 		 405 aa  290  5.0000000000000004e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0374066  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1864  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  42.36 
 
 		 423 aa  289  5.0000000000000004e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0513  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  42.63 
 
 		 423 aa  289  6e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3935  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  41.58 
 
 		 425 aa  289  7e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1334  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  43.12 
 
 		 420 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0101  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  38.5 
 
 		 411 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.495793  normal  0.0768686 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0906  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  41.36 
 
 		 413 aa  287  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.826098  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1543  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  40.34 
 
 		 413 aa  287  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00354872  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0107  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  39.17 
 
 		 413 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0118  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  39.66 
 
 		 413 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2931  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  42.44 
 
 		 420 aa  287  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1324  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  42.86 
 
 		 420 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1120  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  41.9 
 
 		 406 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366661  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2755  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  42.44 
 
 		 420 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2833  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  42.44 
 
 		 420 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0655  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  44.18 
 
 		 423 aa  287  2.9999999999999996e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.188651  normal  0.102422 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3355  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  41.1 
 
 		 413 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.548111 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3024  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  42.86 
 
 		 420 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.823168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1360  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  42.86 
 
 		 420 aa  285  8e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1251  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  41.64 
 
 		 420 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>