More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3166 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3401  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  73.47 
 
 		 426 aa  669    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0552961  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3166  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  100 
 
 		 426 aa  872    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1455  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  57.79 
 
 		 399 aa  488  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0086  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  57.51 
 
 		 388 aa  478  1e-134  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0819  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  57.29 
 
 		 402 aa  480  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.24156 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0708  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  52.77 
 
 		 423 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.810772  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0684  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  52.53 
 
 		 423 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06920  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  56 
 
 		 390 aa  457  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0241  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  53.79 
 
 		 412 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.558186  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1505  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  54.04 
 
 		 415 aa  446  1.0000000000000001e-124  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4709  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  57.95 
 
 		 376 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5027  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  57.95 
 
 		 376 aa  437  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4760  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  57.95 
 
 		 376 aa  437  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4598  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  57.95 
 
 		 376 aa  437  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4620  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  57.95 
 
 		 376 aa  437  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5122  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  57.95 
 
 		 376 aa  437  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0239  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  58.55 
 
 		 367 aa  431  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.440264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4998  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  58.55 
 
 		 367 aa  432  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0909  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  50.12 
 
 		 418 aa  434  1e-120  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.751771  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3503  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  58.33 
 
 		 376 aa  432  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4979  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  58.55 
 
 		 367 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0868  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  54.21 
 
 		 377 aa  430  1e-119  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00134562  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0557  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  50.99 
 
 		 393 aa  430  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.920393  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5008  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  58.55 
 
 		 367 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3198  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  50.49 
 
 		 398 aa  425  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17060  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  50.12 
 
 		 399 aa  425  1e-118  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3797  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  48.8 
 
 		 417 aa  420  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0418315 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0946  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  47.37 
 
 		 416 aa  410  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.807387  normal  0.432603 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1049  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  49.49 
 
 		 382 aa  408  1e-113  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0559  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  54.98 
 
 		 360 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0724  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  52.78 
 
 		 380 aa  405  1.0000000000000001e-112  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0854  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  52.68 
 
 		 379 aa  402  1e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0620001  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3699  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  47.49 
 
 		 417 aa  402  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00250611  normal  0.0813218 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4717  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  46.55 
 
 		 415 aa  394  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.127421  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0561  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  48.95 
 
 		 389 aa  389  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2144  Nucleotidyl transferase  46.82 
 
 		 418 aa  391  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0642356  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0782  Nucleotidyl transferase  48.49 
 
 		 417 aa  384  1e-105  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3698  nucleotidyl transferase  44.44 
 
 		 415 aa  382  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.526056  normal  0.0360642 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3798  Nucleotidyl transferase  45.21 
 
 		 413 aa  378  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.136621 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0947  nucleotidyl transferase  43.96 
 
 		 415 aa  362  8e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4716  nucleotidyl transferase  41.93 
 
 		 407 aa  349  5e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950002  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1368  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  41.65 
 
 		 427 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.782994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05944  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  41.09 
 
 		 404 aa  306  4.0000000000000004e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1529  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  43.83 
 
 		 421 aa  303  5.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116874 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1433  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  41.85 
 
 		 421 aa  301  1e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2838  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  40.64 
 
 		 435 aa  300  4e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0585  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  38.9 
 
 		 440 aa  300  4e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.920968 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0279  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  40.87 
 
 		 427 aa  299  8e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03282  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  41.63 
 
 		 438 aa  297  2e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000760343  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0284  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  42.14 
 
 		 431 aa  297  3e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000350445  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0282  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  42.14 
 
 		 431 aa  297  3e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000242921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03235  hypothetical protein  42.14 
 
 		 431 aa  297  3e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000332683  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4742  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  42.14 
 
 		 431 aa  297  3e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3909  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  42.14 
 
 		 431 aa  297  3e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2459  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  40.39 
 
 		 435 aa  297  3e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3630  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  42.14 
 
 		 431 aa  297  3e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3894  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  42.14 
 
 		 431 aa  297  3e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3712  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  42.14 
 
 		 431 aa  297  3e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.499827  normal  0.460208 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3935  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  41.1 
 
 		 425 aa  296  6e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2073  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  43.14 
 
 		 421 aa  296  7e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000209  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  39.85 
 
 		 405 aa  296  7e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3838  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  40.93 
 
 		 431 aa  295  8e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4645  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  41.63 
 
 		 425 aa  295  1e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0513  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  37.56 
 
 		 423 aa  295  1e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3845  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  40.65 
 
 		 431 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.725074 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3726  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  40.65 
 
 		 431 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3803  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  40.65 
 
 		 431 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4134  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  40.58 
 
 		 425 aa  294  2e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.527563  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3906  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  40.69 
 
 		 431 aa  294  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.732676  normal  0.475217 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3737  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  40.65 
 
 		 431 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0225  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  41.25 
 
 		 428 aa  293  5e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.832621  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1522  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  39.63 
 
 		 425 aa  293  5e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0158195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0718  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  39.25 
 
 		 425 aa  291  1e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.917503  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2061  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  41.09 
 
 		 439 aa  290  2e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0149  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  42.19 
 
 		 428 aa  289  6e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.779964  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0637  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  39.55 
 
 		 407 aa  289  6e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4004  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  42.19 
 
 		 428 aa  289  6e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0905  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  41.79 
 
 		 423 aa  288  9e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.693448  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1691  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  38.81 
 
 		 416 aa  288  1e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.620576  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0959  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  41.29 
 
 		 422 aa  286  4e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1242  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  40.78 
 
 		 417 aa  286  7e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1474  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  42.01 
 
 		 424 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1498  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  42.11 
 
 		 420 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1020  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  41 
 
 		 417 aa  282  8.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0841522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1251  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  41.6 
 
 		 420 aa  282  9e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1324  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  43.95 
 
 		 420 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1334  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  43.95 
 
 		 420 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2932  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  43.16 
 
 		 420 aa  281  1e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00275218  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0385  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  40.47 
 
 		 420 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3024  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  43.95 
 
 		 420 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.823168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0131  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  39.63 
 
 		 423 aa  281  2e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1171  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  41.85 
 
 		 424 aa  280  3e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.591039 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2246  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  39.21 
 
 		 423 aa  280  4e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2931  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  41.6 
 
 		 420 aa  280  4e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1106  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  41.85 
 
 		 421 aa  279  7e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.495993  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0508  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  42.26 
 
 		 422 aa  279  8e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1360  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  43.68 
 
 		 420 aa  278  9e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1330  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  38.18 
 
 		 405 aa  278  1e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0374066  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2886  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  39.74 
 
 		 423 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.935845  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1532  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  39.74 
 
 		 423 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.268941 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>