21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13190 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1868  hypothetical protein  82.48 
 
 
371 aa  647    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139738  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4498  hypothetical protein  79.78 
 
 
371 aa  638    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13190  hypothetical protein  100 
 
 
374 aa  758    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.269746 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1559  hypothetical protein  79.74 
 
 
379 aa  628  1e-179  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.970471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1583  hypothetical protein  79.74 
 
 
379 aa  628  1e-179  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1529  hypothetical protein  78.95 
 
 
379 aa  622  1e-177  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178306  normal  0.470241 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4605  hypothetical protein  74.54 
 
 
381 aa  603  1.0000000000000001e-171  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.360002  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3635  hypothetical protein  71.08 
 
 
373 aa  553  1e-156  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1820  hypothetical protein  62.33 
 
 
371 aa  474  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.153192 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3975  hypothetical protein  45.45 
 
 
361 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7978  hypothetical protein  41.22 
 
 
376 aa  270  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.369377  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2500  hypothetical protein  32.88 
 
 
369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000111187 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4406  hypothetical protein  33.69 
 
 
367 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2219  hypothetical protein  32.53 
 
 
363 aa  161  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2245  hypothetical protein  30.38 
 
 
363 aa  143  4e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0285  hypothetical protein  27.38 
 
 
377 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0819327  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2009  hypothetical protein  26.46 
 
 
377 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0128163  normal  0.280016 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3398  hypothetical protein  27.21 
 
 
371 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.362896  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3673  hypothetical protein  39.56 
 
 
309 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5522  hypothetical protein  22.98 
 
 
345 aa  46.2  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0856  hypothetical protein  34.78 
 
 
352 aa  42.7  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>