18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0285 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0285  hypothetical protein  100 
 
 
377 aa  780    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0819327  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7978  hypothetical protein  29.54 
 
 
376 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.369377  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3975  hypothetical protein  28.33 
 
 
361 aa  106  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3635  hypothetical protein  30.81 
 
 
373 aa  94  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4498  hypothetical protein  30.19 
 
 
371 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1529  hypothetical protein  25.68 
 
 
379 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178306  normal  0.470241 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13190  hypothetical protein  27.38 
 
 
374 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.269746 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1868  hypothetical protein  26.36 
 
 
371 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139738  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4605  hypothetical protein  29.49 
 
 
381 aa  82.8  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.360002  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1559  hypothetical protein  28.64 
 
 
379 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.970471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1583  hypothetical protein  28.64 
 
 
379 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1820  hypothetical protein  26.87 
 
 
371 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.153192 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2500  hypothetical protein  28.5 
 
 
369 aa  75.1  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000111187 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2219  hypothetical protein  33.67 
 
 
363 aa  73.9  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4406  hypothetical protein  28.5 
 
 
367 aa  58.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2245  hypothetical protein  27.64 
 
 
363 aa  50.8  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2009  hypothetical protein  27.97 
 
 
377 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0128163  normal  0.280016 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3398  hypothetical protein  29.31 
 
 
371 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.362896  normal  0.482648 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>