19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7978 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7978  hypothetical protein  100 
 
 
376 aa  763    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.369377  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3975  hypothetical protein  56.94 
 
 
361 aa  387  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3635  hypothetical protein  44.15 
 
 
373 aa  291  2e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1868  hypothetical protein  42.71 
 
 
371 aa  286  5e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139738  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1529  hypothetical protein  41.25 
 
 
379 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178306  normal  0.470241 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4498  hypothetical protein  43.27 
 
 
371 aa  281  1e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1583  hypothetical protein  41.25 
 
 
379 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1559  hypothetical protein  41.25 
 
 
379 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.970471  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13190  hypothetical protein  41.22 
 
 
374 aa  270  2e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.269746 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4605  hypothetical protein  40.73 
 
 
381 aa  262  6e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.360002  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1820  hypothetical protein  42.82 
 
 
371 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.153192 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2500  hypothetical protein  34.76 
 
 
369 aa  205  9e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000111187 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2245  hypothetical protein  34.32 
 
 
363 aa  188  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4406  hypothetical protein  33.78 
 
 
367 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2219  hypothetical protein  34.22 
 
 
363 aa  162  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0285  hypothetical protein  29.54 
 
 
377 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0819327  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3398  hypothetical protein  26.05 
 
 
371 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.362896  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2009  hypothetical protein  24.25 
 
 
377 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0128163  normal  0.280016 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5453  hypothetical protein  37.18 
 
 
172 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.262975 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>