21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1820 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1820  hypothetical protein  100 
 
 
371 aa  759    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.153192 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13190  hypothetical protein  62.33 
 
 
374 aa  474  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.269746 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4498  hypothetical protein  61.79 
 
 
371 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1868  hypothetical protein  60.98 
 
 
371 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139738  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4605  hypothetical protein  60.27 
 
 
381 aa  461  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.360002  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1529  hypothetical protein  60.32 
 
 
379 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178306  normal  0.470241 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1559  hypothetical protein  60.05 
 
 
379 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.970471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1583  hypothetical protein  60.05 
 
 
379 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3635  hypothetical protein  55.68 
 
 
373 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7978  hypothetical protein  42.82 
 
 
376 aa  240  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.369377  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3975  hypothetical protein  41.16 
 
 
361 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2500  hypothetical protein  35.39 
 
 
369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000111187 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4406  hypothetical protein  33.94 
 
 
367 aa  161  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2219  hypothetical protein  33.68 
 
 
363 aa  155  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2245  hypothetical protein  32.27 
 
 
363 aa  147  3e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0285  hypothetical protein  26.87 
 
 
377 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0819327  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2009  hypothetical protein  24.73 
 
 
377 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0128163  normal  0.280016 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3398  hypothetical protein  24.48 
 
 
371 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.362896  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0856  hypothetical protein  32.63 
 
 
352 aa  50.4  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3673  hypothetical protein  37.36 
 
 
309 aa  50.1  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2049  hypothetical protein  35.71 
 
 
308 aa  42.7  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>