19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3635 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3635  hypothetical protein  100 
 
 
373 aa  758    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1868  hypothetical protein  70.54 
 
 
371 aa  560  1e-158  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139738  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1559  hypothetical protein  69.39 
 
 
379 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.970471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1583  hypothetical protein  69.39 
 
 
379 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4498  hypothetical protein  69.46 
 
 
371 aa  552  1e-156  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13190  hypothetical protein  71.08 
 
 
374 aa  553  1e-156  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.269746 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1529  hypothetical protein  68.6 
 
 
379 aa  548  1e-155  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178306  normal  0.470241 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4605  hypothetical protein  65.61 
 
 
381 aa  538  9.999999999999999e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.360002  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1820  hypothetical protein  55.68 
 
 
371 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.153192 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7978  hypothetical protein  44.15 
 
 
376 aa  291  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.369377  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3975  hypothetical protein  43.77 
 
 
361 aa  277  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2500  hypothetical protein  32.08 
 
 
369 aa  196  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000111187 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2219  hypothetical protein  34.77 
 
 
363 aa  172  9e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4406  hypothetical protein  33.6 
 
 
367 aa  160  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2245  hypothetical protein  30.5 
 
 
363 aa  145  9e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0285  hypothetical protein  30.81 
 
 
377 aa  94  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0819327  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2009  hypothetical protein  27.27 
 
 
377 aa  86.7  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0128163  normal  0.280016 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3398  hypothetical protein  28.38 
 
 
371 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.362896  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3584  protein of unknown function DUF1365  31.15 
 
 
254 aa  43.9  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.33232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>