19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2245 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2245  hypothetical protein  100 
 
 
363 aa  733    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2219  hypothetical protein  53.13 
 
 
363 aa  352  5.9999999999999994e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4406  hypothetical protein  51.08 
 
 
367 aa  344  1e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2500  hypothetical protein  47.44 
 
 
369 aa  336  3.9999999999999995e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000111187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7978  hypothetical protein  34.32 
 
 
376 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.369377  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3975  hypothetical protein  33.15 
 
 
361 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4498  hypothetical protein  32.09 
 
 
371 aa  156  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1868  hypothetical protein  31.56 
 
 
371 aa  156  6e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139738  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4605  hypothetical protein  32.45 
 
 
381 aa  154  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.360002  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1529  hypothetical protein  30 
 
 
379 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178306  normal  0.470241 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1820  hypothetical protein  32.27 
 
 
371 aa  147  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.153192 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1583  hypothetical protein  30 
 
 
379 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1559  hypothetical protein  30 
 
 
379 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.970471  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3635  hypothetical protein  30.5 
 
 
373 aa  145  8.000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13190  hypothetical protein  30.38 
 
 
374 aa  143  4e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.269746 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3398  hypothetical protein  26.79 
 
 
371 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.362896  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2009  hypothetical protein  32.31 
 
 
377 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0128163  normal  0.280016 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5453  hypothetical protein  25.27 
 
 
172 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0285  hypothetical protein  27.64 
 
 
377 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0819327  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>