20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4605 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4605  hypothetical protein  100 
 
 		 381 aa  770    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.360002  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4498  hypothetical protein  77.93 
 
 		 371 aa  619  1e-176  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1868  hypothetical protein  78.19 
 
 		 371 aa  617  1e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13190  hypothetical protein  74.54 
 
 		 374 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.269746 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1559  hypothetical protein  75.33 
 
 		 379 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.970471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1583  hypothetical protein  75.33 
 
 		 379 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1529  hypothetical protein  74.54 
 
 		 379 aa  598  1e-170  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178306  normal  0.470241 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3635  hypothetical protein  65.61 
 
 		 373 aa  538  9.999999999999999e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1820  hypothetical protein  60.27 
 
 		 371 aa  461  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153192 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3975  hypothetical protein  43.21 
 
 		 361 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7978  hypothetical protein  40.73 
 
 		 376 aa  262  6e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.369377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2500  hypothetical protein  33.6 
 
 		 369 aa  198  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000111187 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4406  hypothetical protein  33.85 
 
 		 367 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2219  hypothetical protein  35.28 
 
 		 363 aa  161  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2245  hypothetical protein  32.45 
 
 		 363 aa  154  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0285  hypothetical protein  29.49 
 
 		 377 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0819327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2009  hypothetical protein  25.25 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0128163  normal  0.280016 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3398  hypothetical protein  24.48 
 
 		 371 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.362896  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3673  hypothetical protein  36.67 
 
 		 309 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0856  hypothetical protein  34.07 
 
 		 352 aa  43.9  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>