11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0856 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0856  hypothetical protein  100 
 
 		 352 aa  722    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3673  hypothetical protein  28.57 
 
 		 309 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2049  hypothetical protein  26.42 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3437  hypothetical protein  24.59 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0503  hypothetical protein  20.98 
 
 		 332 aa  68.2  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0530  hypothetical protein  24.32 
 
 		 334 aa  65.5  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0126661 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2347  hypothetical protein  22.66 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000400982  hitchhiker  0.00448876 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6230  hypothetical protein  26.44 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0432509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1820  hypothetical protein  32.63 
 
 		 371 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153192 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4605  hypothetical protein  34.07 
 
 		 381 aa  43.9  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.360002  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13190  hypothetical protein  34.78 
 
 		 374 aa  42.7  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.269746 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>