12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0530 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0530  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  699    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0126661 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0503  hypothetical protein  69.76 
 
 		 332 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3437  hypothetical protein  59.52 
 
 		 330 aa  426  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2347  hypothetical protein  48.01 
 
 		 337 aa  316  4e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000400982  hitchhiker  0.00448876 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6230  hypothetical protein  37.5 
 
 		 320 aa  202  6e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0432509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3673  hypothetical protein  26.9 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2049  hypothetical protein  24.24 
 
 		 308 aa  92.8  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0856  hypothetical protein  24.32 
 
 		 352 aa  65.5  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3077  hypothetical protein  20.35 
 
 		 344 aa  46.2  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.257575  normal  0.207932 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1501  hypothetical protein  25.74 
 
 		 329 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1501  hypothetical protein  25.58 
 
 		 329 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.627335  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1524  hypothetical protein  25.58 
 
 		 329 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>