20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12570 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12570  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  269  1e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0730872  normal  0.131277 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2122  PilT domain-containing protein  42.19 
 
 
142 aa  99.4  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0497789  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0415  PilT domain-containing protein  34.38 
 
 
141 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00369357  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1768  hypothetical protein  34.38 
 
 
135 aa  72  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000654349  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2105  PilT protein domain protein  33.82 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.349104 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1361  hypothetical protein  32.81 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.324821  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2128  PilT domain-containing protein  34.09 
 
 
132 aa  63.9  0.0000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3164  PilT domain-containing protein  33.07 
 
 
133 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.702084  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0688  PilT protein-like  31.75 
 
 
132 aa  62  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000301762  unclonable  0.00000000741036 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1872  hypothetical protein  30.71 
 
 
134 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1898  nucleic acid-binding protein contains PIN domain-like protein  30.71 
 
 
134 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1552  PilT protein domain protein  30.08 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4668  hypothetical protein  26.36 
 
 
135 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.264149 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0094  hypothetical protein  31.78 
 
 
135 aa  48.1  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167961  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1623  PilT domain-containing protein  36.96 
 
 
106 aa  48.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.266052  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0829  hypothetical protein  30.66 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1496  PilT protein domain protein  31.75 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.296648  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2473  PilT protein domain protein  31.5 
 
 
144 aa  44.3  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2650  hypothetical protein  28.68 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.722874  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3244  PilT protein domain protein  29.6 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.5216  normal  0.257013 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>