61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_R0003 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_R0003  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.300151 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0032  tRNA-Thr  93.06 
 
 		 72 bp  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0055  tRNA-Thr  93.06 
 
 		 72 bp  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.756499 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0032  tRNA-Thr  93.06 
 
 		 72 bp  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.571749  normal  0.068685 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0020  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.190348 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0057  tRNA-Thr  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.590224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0024  tRNA-Thr  91.8 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0020  tRNA-Thr  91.07 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0020  tRNA-Thr  86.3 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0183484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0054  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0057  tRNA-Thr  88 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0062  tRNA-Thr  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0007  tRNA-Thr  86.3 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0036  tRNA-Met  87.76 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0025  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0017  tRNA-Thr  85.25 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00199817  normal  0.0150591 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0005  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0068  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.496848  normal  0.955384 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0005    90.24 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0040  tRNA-Thr  86.3 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0802458 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0041  tRNA-Thr  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14009  tRNA-Thr  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0061  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122342  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0012  tRNA-Thr  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0044  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.695473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0018  tRNA-Ala  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAThrVIMSS1309299  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0668617 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0021  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0625627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0046  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0468144  normal  0.358768 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0013  tRNA-Ala  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.6257 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0059  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0037  tRNA-Phe  96.3 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000710934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0012  tRNA-Ala  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.556924 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0052  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA51  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0701295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0044  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000154669  normal  0.0727135 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAGlyVIMSS1309363  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0037  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0388732 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t04  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.36184  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0026  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.672407  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4335  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0002  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.231907  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0002  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0044  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110849  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0057  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0072  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.465958  hitchhiker  0.00803701 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0031  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.057517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0017  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.225526  normal  0.0844719 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0005  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0030  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAGlyVIMSS1309069  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAGlyVIMSS1309120  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.15103  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAGlyVIMSS1309187  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAGlyVIMSS1309288  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0313014 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0038  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.70785  normal  0.208879 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAGlyVIMSS1309145  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.732505  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0007  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0275  tRNA-Thr  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000205711  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0004  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0005  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.63313  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0008  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>