67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0738 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0738  Phage baseplate assembly protein V  100 
 
 		 186 aa  379  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0642  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein V  31.36 
 
 		 154 aa  105  4e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.392908  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0364  phage baseplate assembly protein V  32.72 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1165  phage baseplate assembly protein V  32.72 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1145  phage-related baseplate assembly protein  32.72 
 
 		 195 aa  99.8  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0406  phage-related baseplate assembly protein  32.72 
 
 		 195 aa  99.8  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0869  phage baseplate assembly protein V  34.62 
 
 		 211 aa  97.1  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0625663 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37480  Phage P2 baseplate assembly gpV-like protein  35.98 
 
 		 180 aa  95.9  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0893  phage baseplate assembly protein V  32.53 
 
 		 196 aa  93.6  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.176645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4377  baseplate assembly protein V  38.02 
 
 		 213 aa  89  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000317032 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4337  phage baseplate assembly protein GpV  32.05 
 
 		 211 aa  88.6  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0120707 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3039  phage baseplate assembly protein GpV  32.05 
 
 		 211 aa  88.6  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000239621 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1337  hypothetical protein  35.38 
 
 		 226 aa  88.2  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.19388  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1388  Phage-related baseplate assembly protein V  32.45 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.595566  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2341  phage baseplate assembly protein V  33.55 
 
 		 211 aa  85.5  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.962217  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1633  phage-related baseplate assembly protein V  31.25 
 
 		 194 aa  85.1  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3187  phage baseplate assembly protein V  32.48 
 
 		 213 aa  85.1  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.701564  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1827  phage baseplate assembly protein V  33.54 
 
 		 217 aa  84.7  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0087576  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3488  phage baseplate assembly protein V  35.54 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0856237 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3300  phage baseplate assembly protein V  31.71 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01346  phage-related baseplate protein  28.21 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.261049  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3037  phage baseplate assembly protein V  38.68 
 
 		 192 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236294 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2090  phage baseplate assembly protein V  33.96 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.041892  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2902  phage baseplate assembly protein V  35 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.684601 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0194  phage baseplate assembly protein V  33.12 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.263934 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3051  pyocin R2_PP  25.42 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2603  phage baseplate assembly protein V  28.03 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0154554  hitchhiker  0.000000000000278565 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2637  phage baseplate assembly protein V  28.03 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0616276  hitchhiker  0.000571581 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3403  baseplate assembly protein V  30.08 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2854  phage baseplate assembly protein V  32.46 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4046  phage baseplate assembly protein V  30.72 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000659846  hitchhiker  0.000000000000714572 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00847  hypothetical protein  33.96 
 
 		 192 aa  67.8  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08010  hypothetical protein  28.1 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000196385  hitchhiker  0.000218842 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00841  hypothetical protein  33.96 
 
 		 273 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4849  phage baseplate assembly protein V  31.45 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2765  phage baseplate assembly protein V  33.96 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000252262 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0760  hypothetical protein  28.57 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0803813  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1204  phage baseplate assembly protein V  32.28 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690633 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0936  phage baseplate assembly protein V  33.02 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1868  phage baseplate assembly protein V  28.95 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2296  baseplate assembly protein V  42.25 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107943  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2910  prophage MuMc02, baseplate assembly protein V  31.01 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.625329  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1925  phage baseplate assembly-like protein  27.5 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.405057 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2069  hypothetical protein  42.25 
 
 		 84 aa  59.3  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000543099  hitchhiker  0.0000457319 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2183  baseplate assembly protein V, truncation  42.25 
 
 		 84 aa  59.3  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2652  phage baseplate assembly protein V  26.72 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0950236  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1217  phage baseplate assembly protein V  25.32 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1573  phage baseplate assembly protein V  28.95 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.551367  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2889  phage baseplate assembly protein V  28.95 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2302  phage-related baseplate assembly protein V  36.96 
 
 		 145 aa  50.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.580845  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0687  Phage baseplate assembly protein V  25.49 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1294  phage baseplate assembly protein V  28.07 
 
 		 125 aa  50.4  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.455231 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3333  Phage-related baseplate assembly protein V  29.33 
 
 		 175 aa  49.3  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2218  phage baseplate assembly protein V  22.49 
 
 		 301 aa  48.1  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.033632  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2892  hypothetical protein  28.03 
 
 		 499 aa  47.4  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1500  Phage P2 baseplate assembly protein GPV-like protein  32.14 
 
 		 157 aa  47.8  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.889944  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0929  phage baseplate assembly protein V  26.62 
 
 		 177 aa  46.6  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3822  phage baseplate assembly protein V  38.1 
 
 		 193 aa  46.2  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3260  Rhs element Vgr protein  24.84 
 
 		 602 aa  44.7  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386521  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4960  phage baseplate assembly protein V  23.33 
 
 		 172 aa  44.7  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2384  Phage-related baseplate assembly protein V  27.33 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0194  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2324  hypothetical protein  32.47 
 
 		 180 aa  43.5  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.711911  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4546  baseplate  24.68 
 
 		 240 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01988  hypothetical protein  21.88 
 
 		 212 aa  43.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4461  tail spike  24.68 
 
 		 240 aa  42  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1937  baseplate assembly protein V  28.32 
 
 		 193 aa  41.6  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4545  tail spike  24.68 
 
 		 240 aa  40.8  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413404  normal  0.373943 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>